134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3624 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  797    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  84.38 
 
 		 397 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  75.82 
 
 		 397 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  76.07 
 
 		 397 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  76.3 
 
 		 406 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  73.57 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  73.57 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  73.57 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  73.32 
 
 		 401 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  73.07 
 
 		 401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  72.82 
 
 		 401 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  70.82 
 
 		 401 aa  567  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  70.57 
 
 		 401 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  72.5 
 
 		 399 aa  559  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  70.5 
 
 		 399 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  70.5 
 
 		 399 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  68.83 
 
 		 401 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  70.57 
 
 		 401 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  68.75 
 
 		 400 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  66.5 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  68.5 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  68.25 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  43 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  41.25 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  41.65 
 
 		 381 aa  305  7e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  42.25 
 
 		 400 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  42.64 
 
 		 399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  38.25 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  39.55 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  42.21 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  35.09 
 
 		 397 aa  230  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  35.52 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  26.13 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.28 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  24.57 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  25.33 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  22.01 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  23.4 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  24.62 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  23.4 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  23.63 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  24.11 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.6 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  23.13 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  23.13 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  21.41 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  23.02 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  25.3 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  21.91 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  21.91 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  22.84 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  35.94 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  20.83 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  33.05 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  22.68 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  32.2 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  32.2 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  22.33 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  32.2 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.09 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  28.65 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  26.55 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  21.76 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  22.68 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  20.83 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  21.07 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  23.17 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  23.17 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  23.17 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  23.17 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  22.37 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  27.47 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  21.91 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  28.57 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  21.36 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  26.47 
 
 		 384 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  22.3 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  23.68 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  28.32 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  23.64 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  19.57 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  24 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  21.13 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  32.43 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 		 809 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  31.9 
 
 		 859 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  28.24 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  20.51 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  27.22 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>