110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0381 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  38.77 
 
 
377 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  38.64 
 
 
380 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  37.34 
 
 
399 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  32.83 
 
 
400 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  35.88 
 
 
400 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  33.08 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  34.36 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  34.67 
 
 
399 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  34.67 
 
 
399 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  33.61 
 
 
397 aa  209  8e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  36.52 
 
 
399 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  33.08 
 
 
400 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  34.41 
 
 
401 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  35.28 
 
 
400 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  34.59 
 
 
401 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  34.59 
 
 
401 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  34.59 
 
 
401 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  34.34 
 
 
401 aa  202  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  34.42 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  34.84 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  34.34 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  30.77 
 
 
381 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  34 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  36.72 
 
 
400 aa  192  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  33.59 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  36.06 
 
 
397 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  35.5 
 
 
397 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  35.91 
 
 
406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  34.95 
 
 
400 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  35.41 
 
 
400 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  25.26 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  23.32 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0187  hypothetical protein  26.42 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.7 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.65 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  23.17 
 
 
354 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  23.15 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  23.15 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  23.27 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  23.15 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  23.15 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  23.15 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  26.16 
 
 
378 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.42 
 
 
354 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  24.93 
 
 
349 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  21.91 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  22.44 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  21.91 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  23.56 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  22.14 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  22.39 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  21.72 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  22.22 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  24.05 
 
 
399 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  21.88 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  23.41 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  23.88 
 
 
374 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 
376 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  31.65 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  37 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  27.07 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  21.96 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  26.74 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  21.37 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  35.11 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  29.93 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  22.66 
 
 
402 aa  50.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  23.83 
 
 
407 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  21.6 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  22.59 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  26.51 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  21.52 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  21.52 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0392  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  25 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.9 
 
 
375 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  24.16 
 
 
402 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  23.25 
 
 
397 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  21.71 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  23.68 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  23.94 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  33.06 
 
 
808 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  26.83 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03295  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  24.53 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  27.27 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  26.79 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  21.32 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  22.89 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  26.15 
 
 
827 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  27.27 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  30.05 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>