134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3894 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  805    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  46.01 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  45.48 
 
 		 376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  43.09 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  42.5 
 
 		 410 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  38.2 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  33.6 
 
 		 376 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  32.31 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  30.98 
 
 		 407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  25.13 
 
 		 374 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  27.34 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  27.62 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  25.97 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  27.06 
 
 		 384 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  26.99 
 
 		 385 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  26.77 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  26.77 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  29.17 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  25.71 
 
 		 383 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  26.14 
 
 		 390 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  30.13 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  26.12 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  28.69 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  27.97 
 
 		 380 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  26.63 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  27.2 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  26.25 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  26.68 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  28.5 
 
 		 392 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  26.94 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  27.15 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  26.97 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  28.09 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  27.34 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  28.75 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  25.78 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  26.29 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  27.23 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  29.9 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  27.3 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  27.42 
 
 		 389 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  27.3 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  26.63 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  25 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  25.65 
 
 		 397 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  24.87 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  25.73 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  24.87 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  24.47 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  24.6 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  23.32 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  23.76 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  24.02 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  23.32 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  24.1 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  21.83 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  22.12 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.81 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  21.73 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  24.1 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  22.13 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  22.91 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  26.39 
 
 		 842 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.77 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  21.66 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.46 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  21.82 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  23.1 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  23.68 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  21.71 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 		 856 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  21.71 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  21.71 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  21.71 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.77 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  19.27 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  25.83 
 
 		 903 aa  50.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  20.73 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  20.73 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 842 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  22.8 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>