92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0348 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
368 aa  723    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  45.71 
 
 
380 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  44.33 
 
 
375 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  36.58 
 
 
355 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  40.22 
 
 
331 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  29.7 
 
 
354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  29.43 
 
 
354 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  29.7 
 
 
354 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  29.43 
 
 
354 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  29.16 
 
 
354 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  29.16 
 
 
354 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  28.88 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  28.88 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  28.88 
 
 
354 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  28.61 
 
 
354 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  37.77 
 
 
368 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  37.24 
 
 
368 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  35.09 
 
 
361 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.61 
 
 
383 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 
347 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  33.95 
 
 
351 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  27.49 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  27.49 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  24.46 
 
 
362 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34.14 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 
349 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  26.29 
 
 
348 aa  119  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  22.1 
 
 
350 aa  119  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  21.77 
 
 
350 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  27.3 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  27.22 
 
 
348 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  26.95 
 
 
348 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  23.85 
 
 
357 aa  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.47 
 
 
328 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  26.49 
 
 
348 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  23.58 
 
 
353 aa  99  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  22.57 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  22.57 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
838 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  26.12 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  25.73 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  24.67 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  26.52 
 
 
399 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  27.03 
 
 
405 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  23.56 
 
 
653 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  25.49 
 
 
409 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.32 
 
 
841 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  25.77 
 
 
400 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  21.52 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
848 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 
400 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  24.78 
 
 
380 aa  49.3  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  23.67 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  21.32 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.73 
 
 
805 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  26.74 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  22.38 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  27.11 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1848  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein lolC  25.1 
 
 
408 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
853 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  28.93 
 
 
397 aa  46.6  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  34.92 
 
 
838 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 
801 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  22.93 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  19.7 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
856 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.11 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 
822 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.18 
 
 
434 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  22.93 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  22.93 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  22.55 
 
 
797 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  22.93 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  27.96 
 
 
804 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  24.42 
 
 
408 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.27 
 
 
434 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  32.76 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  22.76 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 
857 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  22.65 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  28.23 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  33.67 
 
 
376 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  23.4 
 
 
437 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.13 
 
 
409 aa  43.1  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  28.7 
 
 
381 aa  42.7  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  32.23 
 
 
822 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>