141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0827 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
410 aa  833    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  72.87 
 
 
376 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  72.87 
 
 
376 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  52.42 
 
 
375 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  42.5 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  37.8 
 
 
376 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  35.73 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  38.21 
 
 
407 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 
406 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  32.33 
 
 
414 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  32.37 
 
 
380 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  30 
 
 
380 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  30.17 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  25.68 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  28.42 
 
 
366 aa  154  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
386 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  28.24 
 
 
378 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  31.19 
 
 
392 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
380 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  27.91 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  28.39 
 
 
385 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  26.65 
 
 
378 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  28.86 
 
 
385 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  26.47 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  25.4 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  27.01 
 
 
384 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  26.32 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  26.8 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  25.32 
 
 
378 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  27.46 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  28.01 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  27.03 
 
 
384 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  25.59 
 
 
383 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 
382 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  25.45 
 
 
383 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  26.48 
 
 
392 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  26.61 
 
 
388 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  28.23 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  28.27 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  27.7 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  28.21 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  26.23 
 
 
390 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  28.34 
 
 
390 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  24.09 
 
 
397 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  27.03 
 
 
390 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  26.84 
 
 
392 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  24.63 
 
 
392 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  24.5 
 
 
395 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  27.72 
 
 
391 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  27.94 
 
 
389 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  27.72 
 
 
391 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  27.25 
 
 
389 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  27.88 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  23.08 
 
 
385 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  25.58 
 
 
393 aa  92.8  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  26.89 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  25.19 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  24.23 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  25 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  28.25 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  25.3 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  23.8 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  23.8 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  23.8 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  24.88 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.36 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  24.64 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  23.84 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.13 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  26.96 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  22.17 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  23.52 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  23.67 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  21 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  23.69 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  22.95 
 
 
401 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.05 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  23.39 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  23.92 
 
 
406 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>