82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4323 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  731    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  68.57 
 
 
384 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  58.05 
 
 
379 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  28.61 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  28.99 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 
392 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.74 
 
 
375 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 
407 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.37 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  27.18 
 
 
376 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.36 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  33.12 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  24.94 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  24.74 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  24.74 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  23.71 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  24.16 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  24.87 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  25.25 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  24.94 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.74 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  31.25 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  31.25 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  23.26 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  21.84 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  21.97 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  22.28 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  23.69 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  25.85 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  30.06 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  23.81 
 
 
385 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 
380 aa  63.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 
414 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  30.5 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  22.39 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  31.72 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  19.48 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  23.64 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  30.5 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  22 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  24.48 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  25.32 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  23.98 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  22.53 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  20.55 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 
378 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  23.91 
 
 
398 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  22.88 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  24.36 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  22.28 
 
 
383 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  23.47 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  21.29 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  23.47 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  26.71 
 
 
402 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  22.32 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  23.53 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.88 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  26 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  28.17 
 
 
391 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  26 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  22.14 
 
 
378 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 
399 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  28.17 
 
 
391 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  24.31 
 
 
366 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  20.95 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  23.17 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  25.56 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  24.81 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  24.13 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  24.44 
 
 
391 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  27.33 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 
386 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  26.07 
 
 
391 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>