158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4544 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 372 aa  736    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  51.34 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  28.72 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  26.54 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.16 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  26.95 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  23.88 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  26.47 
 
 		 410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  28.23 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 378 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  27.84 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  26.79 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  27.11 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  27.06 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  27.56 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  26.74 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  28.01 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  26.68 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  27.42 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  25.73 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  24.86 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  25.06 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  26.53 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  23.85 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  27.02 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  26.58 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  23.6 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  26.67 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  28.9 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  26.72 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  21.66 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.83 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  23.39 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  27.03 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  24.6 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  27.72 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  23.87 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  28.98 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  35.04 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  26.12 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  28.4 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  22.39 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  27.01 
 
 		 384 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  23.5 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  24.02 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  28.74 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  25.14 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  27.97 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  25 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  27.97 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  32.76 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  32.76 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  27.97 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  25 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  25.45 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0392  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  27.97 
 
 		 354 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  25.89 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  24.58 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 401 aa  52.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  27.12 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  25.5 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  21.8 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  21.8 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  32.52 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  27.12 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  27.12 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.57 
 
 		 843 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  27.12 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  25.29 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 484 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  32.23 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 873 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  39.76 
 
 		 833 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  31.2 
 
 		 401 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  31.2 
 
 		 401 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  31.2 
 
 		 401 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  31.2 
 
 		 401 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  32.43 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  32.43 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  20.55 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113559 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>