144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3300 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  746    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  49.6 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  43.86 
 
 		 400 aa  342  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  42.61 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  44.61 
 
 		 400 aa  325  9e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  44.61 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  41.1 
 
 		 400 aa  298  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  37.99 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  42.03 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  38.99 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  38.5 
 
 		 399 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  39.1 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  38.25 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  38.9 
 
 		 401 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  38.9 
 
 		 401 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  38.9 
 
 		 401 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  38.65 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  38.6 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  40.35 
 
 		 406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  37.59 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  37.09 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  39.45 
 
 		 397 aa  255  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  39.65 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  37.09 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  38.1 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  38.77 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 		 400 aa  250  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  38.75 
 
 		 400 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  38.79 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  40.7 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  40.45 
 
 		 400 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  34.6 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.4 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  26.72 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  23.39 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  23.39 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  23.44 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  23.65 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  24.37 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  23.65 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  23.45 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  21.88 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  23.45 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  23.49 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.21 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  23.14 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  23.42 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  22.42 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  23.25 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  29.11 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  24.31 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  21.61 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  20.82 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  20.82 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  24.23 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  21.09 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  22.82 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  22.34 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  23.87 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  24.8 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  23.77 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.25 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  25.59 
 
 		 384 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  25.33 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  25.33 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  21.9 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.9 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  19.85 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  22.11 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.31 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  22.48 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  25.54 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  27.56 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  22.48 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  23.17 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  24.88 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  21.65 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  30 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  23.29 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>