96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2585 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  709    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  43.8 
 
 
349 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  43.8 
 
 
349 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 
349 aa  260  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  37.5 
 
 
352 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  37.78 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  36.67 
 
 
353 aa  229  4e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  39.44 
 
 
357 aa  223  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  34.63 
 
 
350 aa  215  8e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  37.05 
 
 
348 aa  210  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  36.77 
 
 
348 aa  209  8e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  37.02 
 
 
348 aa  208  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  32.04 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  32.32 
 
 
354 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 
354 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  31.77 
 
 
354 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  31.22 
 
 
354 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  31.22 
 
 
354 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  31.3 
 
 
354 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 
354 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 
354 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  32.04 
 
 
354 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  29.32 
 
 
362 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 
368 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  28.45 
 
 
351 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  27.82 
 
 
331 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 
375 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  26.63 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  26.63 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.91 
 
 
357 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  22.31 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.93 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  24.8 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  26.08 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  22.68 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  25.19 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  23.25 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  21.65 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  21.79 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  21.63 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  21.63 
 
 
401 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  21.63 
 
 
401 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  21.63 
 
 
401 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.32 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  35.04 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  21.63 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  21.74 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  21.58 
 
 
401 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  26.76 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 
401 aa  56.2  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  22.59 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  22.37 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  29.79 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  31.2 
 
 
374 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 
381 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  27.94 
 
 
401 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  20.97 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  26.14 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 
401 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  22.18 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  23.43 
 
 
366 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  27.07 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  25.64 
 
 
402 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  23.25 
 
 
378 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  25.56 
 
 
400 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.5 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  24.54 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  19.9 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  26.67 
 
 
392 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  31.67 
 
 
798 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  22.8 
 
 
400 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  31.58 
 
 
808 aa  46.2  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  22.96 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  26.32 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  22.3 
 
 
380 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0873  hypothetical protein  22.68 
 
 
756 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
833 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  21.34 
 
 
410 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  23.62 
 
 
398 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0483  hypothetical protein  24.06 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  24 
 
 
779 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  22.7 
 
 
885 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 
397 aa  43.1  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  25 
 
 
735 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 
392 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>