99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1327 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  81.75 
 
 		 400 aa  642    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 400 aa  800    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  88.5 
 
 		 400 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  73.82 
 
 		 401 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  73.82 
 
 		 401 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  73.82 
 
 		 401 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  73.32 
 
 		 401 aa  591  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  73.57 
 
 		 401 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  72.57 
 
 		 401 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  72 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  77.25 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  72.57 
 
 		 401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  72.43 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  72.32 
 
 		 401 aa  578  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  72.43 
 
 		 399 aa  577  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  71.32 
 
 		 401 aa  565  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  69 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  75.25 
 
 		 400 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  70.17 
 
 		 406 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  70.07 
 
 		 401 aa  537  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  68.75 
 
 		 397 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  69.5 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  40 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  41.94 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  40.84 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  41.15 
 
 		 399 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  41.19 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  38.75 
 
 		 377 aa  259  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  39.95 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  37.72 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  34.66 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  36.72 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.75 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.7 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  22.52 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  24.76 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  26.7 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  30 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  30 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  29.17 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  22.87 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  27.65 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  23.19 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  27.11 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  22.81 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  22.81 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  29.17 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  29.17 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  19.76 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  21.83 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  24.19 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  23.37 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  22.97 
 
 		 378 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.95 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.49 
 
 		 809 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  28.57 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  20.59 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  24.71 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  26.63 
 
 		 384 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  25 
 
 		 392 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.24 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 372 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.86 
 
 		 646 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  20.36 
 
 		 389 aa  46.2  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  24.41 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  26.25 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  29.92 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  29.92 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.18 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.43 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.42 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  22.63 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  28.67 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  27.72 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  24.37 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  26.97 
 
 		 841 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  22.88 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  28.28 
 
 		 793 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  23.84 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  22.72 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  22.38 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  22.72 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  22.72 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  22.72 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 386 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  22.7 
 
 		 378 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>