119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1005 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 349 aa  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  66.19 
 
 		 349 aa  494  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  66.19 
 
 		 349 aa  494  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  41.94 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  36.41 
 
 		 348 aa  235  7e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  38.03 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  34.65 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  34.17 
 
 		 352 aa  212  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  38.35 
 
 		 348 aa  206  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  37.29 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  38.35 
 
 		 348 aa  203  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  38.07 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  31.28 
 
 		 354 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  31.98 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  31.98 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  31.71 
 
 		 354 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  31.56 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  31.56 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 		 354 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  30.17 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 380 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  26.61 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  26.61 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.5 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  24.72 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.74 
 
 		 383 aa  93.6  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  22.13 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  24.59 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  19.38 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  26.01 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.68 
 
 		 835 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  19.79 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  24.87 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  21.07 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  18.23 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  17.98 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  24.88 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  22.64 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  20.29 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  24 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  20.87 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  21.41 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  20.48 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  24.46 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  20.48 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  20.48 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  20.48 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  20.22 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  20.75 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  25.16 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  21.48 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  21.19 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  23.21 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  18.72 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  28.93 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  25.16 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  17.6 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  25.56 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  23.38 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  19.73 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  19.73 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  23.32 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  23.44 
 
 		 452 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  23.26 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  19.36 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  25.15 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0483  hypothetical protein  23.9 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  23.21 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2865  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  20.62 
 
 		 857 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.42 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 		 855 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  20.75 
 
 		 853 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.3 
 
 		 434 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  19.84 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.75 
 
 		 880 aa  46.2  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 		 462 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  21.73 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  21.16 
 
 		 852 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  21.18 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  25.16 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20 
 
 		 749 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>