60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4604 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 351 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  45.87 
 
 		 331 aa  242  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  44.84 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  46.09 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  42.75 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  41.27 
 
 		 355 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  42.7 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  45.65 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  41.76 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  33.16 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  26.67 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  26.67 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  26.94 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 354 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 354 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  26.24 
 
 		 354 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  26.94 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  26.39 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  23.1 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  28.45 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  24.79 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  24.79 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  39.5 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  23.25 
 
 		 350 aa  96.7  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  22.54 
 
 		 349 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  20.67 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  22.07 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  23.04 
 
 		 353 aa  86.3  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  22.47 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  22.22 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  22.22 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  25.08 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  22.71 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  21.94 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  21.67 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  24.93 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.46 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  21.22 
 
 		 829 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  21.22 
 
 		 829 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  21.65 
 
 		 684 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  27.25 
 
 		 405 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  19.92 
 
 		 779 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  21.16 
 
 		 779 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  21.4 
 
 		 775 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  25.14 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  21.7 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  20.33 
 
 		 772 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  21.34 
 
 		 779 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  21.34 
 
 		 779 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  21.34 
 
 		 779 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  33.05 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  21.34 
 
 		 735 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  28.65 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>