45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2883 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 347 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  41.23 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  46.09 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  42.3 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  41.73 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  40.71 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  37.36 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.34 
 
 		 383 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  33.68 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  38.33 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  27.55 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  27.15 
 
 		 354 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  27.15 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 		 354 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  27 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  27.15 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  27 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  27 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  23.1 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  24.65 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  27.17 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  21.81 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  25.42 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.13 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  25.35 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  25.35 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  25.35 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  23.45 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  23.31 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  23.45 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  23.31 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  22.25 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  24.09 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  24.72 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  23.38 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.19 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  22.36 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  22.59 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  26.74 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 408 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>