121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00290 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  100 
 
 		 357 aa  687    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  46.89 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  44.96 
 
 		 361 aa  247  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  49.6 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  42.82 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  39.5 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  41.76 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  35.88 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  42.59 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  38.66 
 
 		 347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  34.47 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  35.64 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  40.67 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  27.95 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  27.95 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  27.91 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  27.7 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  27.7 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  26.58 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  27.4 
 
 		 354 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  27.64 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  27.64 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  27.45 
 
 		 352 aa  119  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  24.44 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  22.91 
 
 		 356 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  25.41 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  24.18 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  23.63 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  24.6 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  25.2 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  24.66 
 
 		 348 aa  95.9  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  24.38 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  24.38 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  24.66 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  23.5 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  26.09 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  24.8 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  24.54 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28.97 
 
 		 841 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  21.21 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.67 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  34.72 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  28.07 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  27.46 
 
 		 821 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.05 
 
 		 835 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.79 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.39 
 
 		 391 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  28.53 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.81 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.1 
 
 		 400 aa  52.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  33.33 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  25.53 
 
 		 818 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  28.16 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.93 
 
 		 843 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  33.86 
 
 		 407 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  34.92 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  34.19 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  31.1 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  33.56 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  32.26 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  24.57 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  25.32 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.61 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  31.91 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  23.25 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.59 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2397  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  22.96 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  27.95 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.94 
 
 		 819 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  24.78 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.55 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  21.66 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 		 848 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  37.5 
 
 		 798 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.24 
 
 		 842 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  25.65 
 
 		 818 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  28.38 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  23.96 
 
 		 787 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  34.65 
 
 		 400 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 		 395 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  26.28 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  28.68 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  26.04 
 
 		 815 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  23.06 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  31.62 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  27.27 
 
 		 804 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25.38 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  33.61 
 
 		 822 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>