90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0572 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  100 
 
 		 348 aa  681    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  99.43 
 
 		 348 aa  677    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  97.41 
 
 		 348 aa  624  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  56.32 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  40.23 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  42.54 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  38.64 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  37.22 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  37.22 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  37.29 
 
 		 356 aa  225  7e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  38.35 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  35.65 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  31.56 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  30.73 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  31.28 
 
 		 354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  31.56 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  31.01 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  31.01 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  31.56 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  29.4 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  28.37 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  28.37 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  25.41 
 
 		 361 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  25.35 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  23.86 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  21.88 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.8 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  21.39 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  18.99 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  30.09 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  21.24 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  26.47 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  22.07 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  22.07 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  26.97 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  26.25 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  20.79 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  20.79 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  20 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  27.21 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  25.15 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  27.21 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  27.21 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  27.21 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0999  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00052376  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.92 
 
 		 386 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  28.47 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  22.53 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 399 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  28.26 
 
 		 409 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  26.47 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  21.05 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.7 
 
 		 842 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  19.28 
 
 		 821 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  29.91 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  20.92 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  23.45 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1387  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.41 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  27.57 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  20.1 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  24.34 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  24.34 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  20.79 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  22.43 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  20.83 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  29.46 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  25.4 
 
 		 404 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  24.19 
 
 		 381 aa  43.1  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  26.28 
 
 		 401 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  23.68 
 
 		 388 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  24.58 
 
 		 451 aa  43.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2360  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.7 
 
 		 411 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.069448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  23.14 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>