153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4337 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  100 
 
 		 876 aa  1685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  48.23 
 
 		 806 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  23.12 
 
 		 789 aa  108  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 797 aa  104  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  22.49 
 
 		 791 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 		 792 aa  97.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  26.15 
 
 		 788 aa  96.3  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  26.36 
 
 		 787 aa  93.2  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  24.52 
 
 		 787 aa  89.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  27.42 
 
 		 790 aa  89.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  22.51 
 
 		 788 aa  89  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 789 aa  89  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 789 aa  89  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  25.09 
 
 		 789 aa  87.8  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  21.44 
 
 		 792 aa  87.8  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  19.9 
 
 		 792 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  25.25 
 
 		 787 aa  78.2  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 		 1143 aa  74.3  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  23.91 
 
 		 1232 aa  74.3  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  25.53 
 
 		 793 aa  73.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  24.45 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  20.12 
 
 		 876 aa  72.8  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 788 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  25.59 
 
 		 791 aa  69.3  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  23.84 
 
 		 793 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  22.05 
 
 		 774 aa  68.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  23.19 
 
 		 786 aa  68.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 		 787 aa  68.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 1177 aa  67.8  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  21.4 
 
 		 1132 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  21.21 
 
 		 833 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  25.04 
 
 		 789 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  27.55 
 
 		 787 aa  63.9  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  20.7 
 
 		 1132 aa  63.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  25.71 
 
 		 788 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 		 786 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  27.05 
 
 		 786 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  24.2 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  22.3 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  24.5 
 
 		 787 aa  60.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  22.42 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  26.32 
 
 		 787 aa  60.1  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  22.92 
 
 		 787 aa  60.1  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  19.46 
 
 		 947 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  27.86 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  18.25 
 
 		 1068 aa  58.2  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  23.99 
 
 		 847 aa  57.4  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  20.18 
 
 		 1016 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  22.55 
 
 		 362 aa  57.4  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  30.5 
 
 		 863 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.24 
 
 		 419 aa  55.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  23.56 
 
 		 788 aa  55.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 		 849 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  21.88 
 
 		 868 aa  55.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  24.15 
 
 		 794 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  24.15 
 
 		 850 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  34.46 
 
 		 452 aa  54.7  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 		 941 aa  54.3  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  26.63 
 
 		 408 aa  54.3  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 		 849 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 		 419 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.38 
 
 		 811 aa  53.5  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  32.5 
 
 		 850 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  24.11 
 
 		 787 aa  52.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  18.2 
 
 		 859 aa  52  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  31.05 
 
 		 873 aa  52.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 790 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1090 aa  51.6  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 		 443 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  26.34 
 
 		 411 aa  50.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.19 
 
 		 413 aa  50.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  27.74 
 
 		 419 aa  50.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 386 aa  50.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  33.58 
 
 		 387 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  25.81 
 
 		 413 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 		 847 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.08 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  20.77 
 
 		 389 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 775 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.47 
 
 		 423 aa  50.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  31.09 
 
 		 847 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  26.37 
 
 		 427 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  32.56 
 
 		 400 aa  49.7  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  32.56 
 
 		 866 aa  49.7  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 		 417 aa  49.7  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.91 
 
 		 439 aa  48.9  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 838 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  24.53 
 
 		 821 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1376  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.63 
 
 		 443 aa  48.5  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0730301  normal  0.0697431 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  18.11 
 
 		 773 aa  48.5  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 		 917 aa  48.1  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.5 
 
 		 389 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  22.84 
 
 		 441 aa  48.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  41.98 
 
 		 859 aa  47.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.39 
 
 		 411 aa  47.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  21.52 
 
 		 787 aa  47.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  28.57 
 
 		 416 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 466 aa  47.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>