87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2205 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  63.31 
 
 
787 aa  946    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  100 
 
 
787 aa  1559    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  45.49 
 
 
787 aa  668    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  45.36 
 
 
787 aa  671    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  43.95 
 
 
787 aa  621  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  40.79 
 
 
787 aa  615  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  41.42 
 
 
787 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  43.38 
 
 
793 aa  598  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  42.12 
 
 
788 aa  586  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  40.91 
 
 
787 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  43.87 
 
 
789 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  42.31 
 
 
787 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  40.15 
 
 
789 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  40.15 
 
 
789 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  40.28 
 
 
787 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  39.77 
 
 
787 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  42.75 
 
 
790 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  42.31 
 
 
787 aa  558  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  41.95 
 
 
787 aa  558  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  39.29 
 
 
789 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  43.15 
 
 
786 aa  542  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  43.15 
 
 
786 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  38.88 
 
 
786 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  36.73 
 
 
788 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  43.02 
 
 
786 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  40.1 
 
 
789 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  40.68 
 
 
791 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  42.17 
 
 
786 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  38.01 
 
 
788 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  38.72 
 
 
788 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  39.95 
 
 
788 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  38.99 
 
 
793 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  38.14 
 
 
793 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  39.09 
 
 
787 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  36.56 
 
 
800 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  39.77 
 
 
790 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  39.24 
 
 
789 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  31.42 
 
 
792 aa  366  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 
792 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  32.04 
 
 
792 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  27.91 
 
 
791 aa  325  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
797 aa  309  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  27.8 
 
 
787 aa  263  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 
774 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  25.14 
 
 
947 aa  156  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  22.16 
 
 
859 aa  150  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  23.18 
 
 
1090 aa  141  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  21.73 
 
 
1132 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  25.55 
 
 
868 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  21.2 
 
 
1132 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 
1016 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 
1177 aa  117  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
1110 aa  116  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  22.16 
 
 
1068 aa  115  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  23.03 
 
 
1143 aa  106  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 
743 aa  97.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  25.33 
 
 
917 aa  96.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  20.25 
 
 
773 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.08 
 
 
876 aa  92.4  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  20.94 
 
 
737 aa  90.5  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.15 
 
 
1232 aa  87.8  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  21.77 
 
 
749 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.34 
 
 
1211 aa  79.7  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  22.37 
 
 
759 aa  74.7  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  25.14 
 
 
806 aa  67.4  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25.99 
 
 
411 aa  58.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 
852 aa  58.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  24.61 
 
 
876 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  22.15 
 
 
856 aa  52.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0792  hypothetical protein  22.99 
 
 
714 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.19 
 
 
857 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
839 aa  48.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 
416 aa  47.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.17 
 
 
870 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.23 
 
 
420 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  23.1 
 
 
423 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.67 
 
 
858 aa  46.2  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  25.69 
 
 
362 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 
822 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  24.6 
 
 
389 aa  45.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.14 
 
 
880 aa  45.4  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 
386 aa  45.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  31.9 
 
 
671 aa  45.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0511  hypothetical protein  33.75 
 
 
1753 aa  44.7  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.665267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 
855 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 
846 aa  44.3  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  21.14 
 
 
414 aa  44.3  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>