22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0511 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl261  unknown substrate ABC transporter permease component  36.06 
 
 
1693 aa  800    Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000900021  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl262  unknown substrate ABC transporter permease component  32.42 
 
 
1724 aa  775    Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00148086  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0511  hypothetical protein  100 
 
 
1753 aa  3472    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.665267  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0018  hypothetical protein  29.66 
 
 
1797 aa  610  1e-173  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0270  ABC transporter, permease protein, putative  28.41 
 
 
1768 aa  529  1e-148  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.752032  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl159  unknown substrate ABC transporter permease component  26.1 
 
 
1814 aa  339  1.9999999999999998e-91  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.762494  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl156  unknown substrate ABC transporter permease  23.97 
 
 
1429 aa  75.9  0.000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0664  hypothetical protein  23.97 
 
 
1381 aa  64.7  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.315875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  20.11 
 
 
737 aa  59.7  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  23.55 
 
 
791 aa  54.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  23.1 
 
 
787 aa  52  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf117  ABC transporter permease protein  25.76 
 
 
2777 aa  50.1  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.247181  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0323  efflux ABC transporter, permease protein  24.61 
 
 
1575 aa  49.3  0.0006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.212525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 
797 aa  49.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  22.07 
 
 
947 aa  49.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  26.91 
 
 
859 aa  48.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  25.35 
 
 
787 aa  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.52 
 
 
743 aa  46.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  22.53 
 
 
788 aa  46.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  22.64 
 
 
789 aa  46.2  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  26.62 
 
 
896 aa  45.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  26.26 
 
 
858 aa  45.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>