155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5172 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  100 
 
 		 788 aa  1552    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  44.29 
 
 		 789 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  45.3 
 
 		 789 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  44.29 
 
 		 789 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  44.04 
 
 		 789 aa  609  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  41.67 
 
 		 787 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  43.08 
 
 		 787 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  42.31 
 
 		 787 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  41.79 
 
 		 787 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  41.68 
 
 		 788 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  42.18 
 
 		 787 aa  569  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  41.28 
 
 		 787 aa  568  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  42.24 
 
 		 793 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  41.74 
 
 		 793 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  40.28 
 
 		 787 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  39.85 
 
 		 786 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  40.91 
 
 		 787 aa  524  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  35.2 
 
 		 788 aa  522  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  41.05 
 
 		 789 aa  521  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  38.91 
 
 		 788 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  38.08 
 
 		 787 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  38.36 
 
 		 791 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  37.78 
 
 		 800 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  38.72 
 
 		 787 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  39.49 
 
 		 790 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  37.58 
 
 		 793 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  37.95 
 
 		 787 aa  475  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  37.72 
 
 		 787 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  37.77 
 
 		 787 aa  469  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  37.52 
 
 		 787 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  38.75 
 
 		 788 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  38.97 
 
 		 789 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  37.74 
 
 		 786 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 		 786 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  37.74 
 
 		 786 aa  429  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  38.17 
 
 		 790 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  36.9 
 
 		 786 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  31.11 
 
 		 792 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  27.94 
 
 		 791 aa  294  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 792 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 		 797 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 		 792 aa  263  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  29.41 
 
 		 787 aa  249  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 774 aa  178  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  25.09 
 
 		 1132 aa  157  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  24.32 
 
 		 1132 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  26.15 
 
 		 947 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 		 1016 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1090 aa  122  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  19.68 
 
 		 773 aa  121  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  23.46 
 
 		 759 aa  117  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  21.98 
 
 		 859 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.45 
 
 		 868 aa  111  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  21.47 
 
 		 1143 aa  109  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 1177 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.6 
 
 		 1232 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.15 
 
 		 743 aa  99.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.63 
 
 		 876 aa  99  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  26.71 
 
 		 806 aa  97.4  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  20.22 
 
 		 1068 aa  96.7  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.64 
 
 		 917 aa  94.7  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 		 1110 aa  94  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.88 
 
 		 737 aa  85.9  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  25.42 
 
 		 876 aa  81.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.17 
 
 		 1211 aa  63.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  21.28 
 
 		 821 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.56 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.03 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.78 
 
 		 416 aa  56.6  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.74 
 
 		 427 aa  56.6  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.39 
 
 		 427 aa  55.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 		 839 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  22.91 
 
 		 393 aa  52.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 848 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.32 
 
 		 858 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.3 
 
 		 416 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.57 
 
 		 417 aa  51.6  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.13 
 
 		 439 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.38 
 
 		 439 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.67 
 
 		 416 aa  51.2  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.69 
 
 		 417 aa  50.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.86 
 
 		 417 aa  50.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.51 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 		 846 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.83 
 
 		 416 aa  50.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.38 
 
 		 439 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.63 
 
 		 414 aa  50.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.36 
 
 		 406 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.42 
 
 		 427 aa  50.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 		 941 aa  49.7  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  23.68 
 
 		 838 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.54 
 
 		 416 aa  49.3  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0747  lipoprotein releasing system  27.56 
 
 		 428 aa  49.3  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.25 
 
 		 433 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  41.94 
 
 		 387 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  27.78 
 
 		 400 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  26.88 
 
 		 419 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 		 852 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.67 
 
 		 856 aa  48.5  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.35 
 
 		 422 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>