87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3437 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  100 
 
 		 800 aa  1590    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  77.92 
 
 		 788 aa  1218    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  40.36 
 
 		 787 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  41.88 
 
 		 787 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  41.78 
 
 		 787 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  38.78 
 
 		 788 aa  568  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  42.62 
 
 		 787 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  41.82 
 
 		 793 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  40.46 
 
 		 793 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  41.41 
 
 		 788 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  41.4 
 
 		 789 aa  525  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  37.77 
 
 		 789 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  38.51 
 
 		 787 aa  515  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  39.17 
 
 		 787 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  38.99 
 
 		 786 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  38.61 
 
 		 789 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  38.61 
 
 		 789 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 		 787 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  38.02 
 
 		 787 aa  501  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  39.29 
 
 		 790 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  37.23 
 
 		 787 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  39.65 
 
 		 787 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  41.39 
 
 		 790 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  38.64 
 
 		 788 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  37.78 
 
 		 788 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  36.04 
 
 		 787 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  36.56 
 
 		 787 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  37.9 
 
 		 789 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  36.51 
 
 		 791 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  36.7 
 
 		 793 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  36.98 
 
 		 786 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  37.58 
 
 		 786 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 		 787 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 		 786 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  36.72 
 
 		 786 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  36.62 
 
 		 789 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  36.35 
 
 		 787 aa  402  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  31.83 
 
 		 792 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  29.57 
 
 		 791 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 		 792 aa  303  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 		 792 aa  294  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 		 797 aa  248  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  27.12 
 
 		 787 aa  238  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 		 774 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  23.55 
 
 		 947 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  21.87 
 
 		 1016 aa  112  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  22.01 
 
 		 1132 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  19.3 
 
 		 773 aa  111  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  20.71 
 
 		 743 aa  110  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 		 1177 aa  109  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.12 
 
 		 1132 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  22.71 
 
 		 868 aa  103  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 		 1110 aa  101  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  20.37 
 
 		 859 aa  96.3  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1090 aa  94.7  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  21.2 
 
 		 759 aa  92.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.38 
 
 		 917 aa  92.4  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  20.12 
 
 		 737 aa  90.5  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  20.93 
 
 		 876 aa  89.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  21.4 
 
 		 749 aa  84.3  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  23.61 
 
 		 1232 aa  82.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.05 
 
 		 1143 aa  74.7  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  20.17 
 
 		 1068 aa  73.6  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.52 
 
 		 1211 aa  68.6  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  24.32 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  23.25 
 
 		 419 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 		 878 aa  52.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.4 
 
 		 825 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  26.7 
 
 		 401 aa  52  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 848 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.48 
 
 		 854 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  27.72 
 
 		 400 aa  50.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03260  predicted membrane protein  23.67 
 
 		 961 aa  48.5  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.484426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 		 852 aa  48.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  26.37 
 
 		 400 aa  47.8  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 839 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.86 
 
 		 842 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 		 853 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25 
 
 		 841 aa  45.8  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  28.38 
 
 		 844 aa  45.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  22.3 
 
 		 873 aa  44.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  31.3 
 
 		 384 aa  44.7  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  23.63 
 
 		 821 aa  44.3  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 		 840 aa  44.3  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  22.51 
 
 		 414 aa  43.9  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1074  hypothetical protein  21.31 
 
 		 866 aa  43.9  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  34.43 
 
 		 832 aa  44.3  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>