59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1708 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1708  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 
504 aa  1008    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2395  hypothetical protein  33.33 
 
 
625 aa  170  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.553674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1481  membrane protein-like protein  28.91 
 
 
770 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0291099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  21.89 
 
 
863 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  23.61 
 
 
767 aa  80.1  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  30.1 
 
 
1111 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  23.8 
 
 
642 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.23 
 
 
769 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  26.83 
 
 
666 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03260  predicted membrane protein  28.1 
 
 
961 aa  58.9  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.484426 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  25.75 
 
 
663 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  25.6 
 
 
666 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  28.16 
 
 
1114 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  28.51 
 
 
915 aa  58.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  29.86 
 
 
1037 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  26.83 
 
 
666 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.67 
 
 
782 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  25.47 
 
 
666 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.41 
 
 
678 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11800  X-X-X-Leu-X-X-Gly heptad repeat-containing protein  24.3 
 
 
853 aa  55.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  25.6 
 
 
666 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  27.23 
 
 
911 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  26.83 
 
 
666 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  26.83 
 
 
666 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  26.83 
 
 
666 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  23.97 
 
 
1038 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 
733 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.77 
 
 
946 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  26.67 
 
 
512 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.94 
 
 
797 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  26.01 
 
 
923 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  26.36 
 
 
819 aa  50.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.6 
 
 
631 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  26.01 
 
 
924 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  35.83 
 
 
678 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  30.3 
 
 
988 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  27.37 
 
 
982 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  26.27 
 
 
695 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  22.6 
 
 
1038 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  35.8 
 
 
623 aa  47.8  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  23.05 
 
 
869 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.25 
 
 
869 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.25 
 
 
869 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.25 
 
 
869 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  31.9 
 
 
772 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.88 
 
 
646 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  26.18 
 
 
597 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  23.68 
 
 
1038 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  24.39 
 
 
1054 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  22.33 
 
 
1041 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.58 
 
 
737 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  37.66 
 
 
1246 aa  46.2  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2261  hypothetical protein  31.03 
 
 
266 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000562988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  23 
 
 
810 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  42.62 
 
 
732 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.72 
 
 
666 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  21.23 
 
 
1038 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  21.84 
 
 
888 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  27 
 
 
683 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>