70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11800  X-X-X-Leu-X-X-Gly heptad repeat-containing protein  100 
 
 		 853 aa  1659    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.032406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1481  membrane protein-like protein  30.69 
 
 		 770 aa  300  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0291099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  26.16 
 
 		 863 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  26.01 
 
 		 767 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  29.66 
 
 		 642 aa  146  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  25.26 
 
 		 924 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  25.54 
 
 		 911 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.87 
 
 		 869 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.87 
 
 		 869 aa  100  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.87 
 
 		 869 aa  100  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  26.13 
 
 		 1114 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1246 aa  97.8  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  24.43 
 
 		 923 aa  96.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  26.19 
 
 		 869 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  27.1 
 
 		 915 aa  96.3  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  26.61 
 
 		 1111 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.23 
 
 		 797 aa  89.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  28.14 
 
 		 955 aa  89  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 825 aa  87.8  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2395  hypothetical protein  25.61 
 
 		 625 aa  84.3  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.553674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  30.26 
 
 		 882 aa  79.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  27.93 
 
 		 772 aa  79  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.35 
 
 		 782 aa  76.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.73 
 
 		 737 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29 
 
 		 769 aa  72.8  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0160  hypothetical protein  26.93 
 
 		 630 aa  67.4  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  43.56 
 
 		 732 aa  66.6  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1002 aa  63.5  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.89 
 
 		 857 aa  63.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  41.57 
 
 		 683 aa  62.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  36.15 
 
 		 1037 aa  62.4  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  30.07 
 
 		 819 aa  60.8  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 982 aa  58.9  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125327 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  24.4 
 
 		 623 aa  58.2  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.17 
 
 		 692 aa  56.2  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  23.75 
 
 		 772 aa  55.8  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  26.62 
 
 		 789 aa  54.7  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 733 aa  54.3  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1708  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  24.06 
 
 		 504 aa  53.9  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.15 
 
 		 946 aa  53.5  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  39.29 
 
 		 988 aa  52.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  28.45 
 
 		 666 aa  52.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  29.7 
 
 		 666 aa  52  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  28.45 
 
 		 666 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 678 aa  51.2  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  28.45 
 
 		 666 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  45.9 
 
 		 631 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  28.45 
 
 		 666 aa  51.2  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  28.45 
 
 		 663 aa  51.2  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  39.24 
 
 		 702 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  34.26 
 
 		 759 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  26.45 
 
 		 666 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  28.45 
 
 		 666 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  28.24 
 
 		 666 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  27.59 
 
 		 512 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  33.63 
 
 		 678 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  35.04 
 
 		 695 aa  47.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  24.81 
 
 		 953 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  34.62 
 
 		 785 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.21 
 
 		 740 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1041 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  29.91 
 
 		 1041 aa  45.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  29.91 
 
 		 1038 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  34.75 
 
 		 1068 aa  45.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  33.96 
 
 		 1054 aa  45.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3269  low complexity protein, contains internal repeats QQVlQQDVAQLQAG  26.76 
 
 		 198 aa  44.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2261  hypothetical protein  33.11 
 
 		 266 aa  44.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000562988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  28.97 
 
 		 810 aa  44.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  34.44 
 
 		 823 aa  44.3  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  25.24 
 
 		 1038 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>