25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0664 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl156  unknown substrate ABC transporter permease  38.13 
 
 
1429 aa  870    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0664  hypothetical protein  100 
 
 
1381 aa  2725    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.315875  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf117  ABC transporter permease protein  24.05 
 
 
2777 aa  87  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.247181  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0323  efflux ABC transporter, permease protein  21.04 
 
 
1575 aa  82.8  0.00000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.212525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  19.96 
 
 
749 aa  71.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl261  unknown substrate ABC transporter permease component  22.13 
 
 
1693 aa  68.6  0.0000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000900021  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0018  hypothetical protein  23.48 
 
 
1797 aa  67.8  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0511  hypothetical protein  23.97 
 
 
1753 aa  66.2  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.665267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  22.72 
 
 
792 aa  60.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0270  ABC transporter, permease protein, putative  23.54 
 
 
1768 aa  60.1  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.752032  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl262  unknown substrate ABC transporter permease component  20.81 
 
 
1724 aa  57.4  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00148086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.38 
 
 
811 aa  53.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 
797 aa  52  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl159  unknown substrate ABC transporter permease component  21.97 
 
 
1814 aa  50.4  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.762494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  29.91 
 
 
408 aa  50.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  29.09 
 
 
787 aa  49.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  20.67 
 
 
787 aa  48.9  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  19.53 
 
 
791 aa  48.5  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
1143 aa  46.6  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  26.17 
 
 
789 aa  47  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.84 
 
 
415 aa  45.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.6 
 
 
414 aa  45.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  20.42 
 
 
737 aa  45.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.88 
 
 
427 aa  45.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1851  ABC transporter, permease protein, putative  33.75 
 
 
506 aa  45.1  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00637092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>