| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | MCAP_0664 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 3828560 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_007633 |
|---|
| Strand | - |
|---|
| Start bp | 790881 |
|---|
| End bp | 795026 |
|---|
| Gene Length | 4146 bp |
|---|
| Protein Length | 1381 aa |
|---|
| Translation table | 4 |
|---|
| GC content | 21% |
|---|
| IMG OID | 637823816 |
|---|
| Product | hypothetical protein |
|---|
| Protein accession | YP_424628 |
|---|
| Protein GI | 83319508 |
|---|
| COG category | |
|---|
| COG ID | |
|---|
| TIGRFAM ID | [TIGR01131] ATP synthase subunit 6 (eukaryotes),also subunit A (prokaryotes) |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 1 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 0.315875 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | n/a |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | n/a |
|---|
| Fosmid clonability | n/a |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | ATGAAAACTA AATATCAAAA AAGAGATAAA TGGTTAGGTC TAATTTTAAA AAACTCTTTA
AAAAACTCTT TTAAATATAA ATCACAATTG CTTGGATTAG TTTTATTAGT GATGATTATG
AGTTTAATTA TGTCTTTAAT ATCAGCAATT AACTCAAGAG TTTTAAATAA ATATGATAAT
TTGATTACTA ATTCTAATCA ACATAATTTA GTTTTAAAAT TAGATCCATA TGAAAATTTA
CCAACCAGTT TAATTACTTC TAATAATCAA ATTCAAGCTC AACAGCAATA TATCAATCGT
TTAAATGAAA AACTATATTC TAGATATAAT TTTAAGTTTG ATTGATCAAG AACTGAATCA
CGTGAATTTA AACAAGTTAA ATCTTTAAAT AATTTACAAA CATTAAAAGC TATTTCAAAA
CAATATTTAA CTAATAATAA AGTTGATCAA ATAGTAATTG TTAAAGGTAG AAATATTAAT
TCAAATAAAG AAGTTGTAAT TGACCCAATT TATGCTAAAA AACATAATAT TAAAATTAAT
GACATTATTA GATTTCAAAA AGATGTTTTA GGTGATCAAT TATTAGTAAA TTCATTAAAT
AATAAACAAA CTACTCAAGA ACAATTTAAT GATATTAATA AAATTACAAA ACAAGGATTA
ACTGATGTTA ATGGTATTTA TCAGATTAAA TATGCAAGTA GTTTTGATTG ATACCAAGTA
GTTGGTTTTG CAAATTCTGC TGATTTTATT TTTCCAACCA TTAATGCTTA TACACCAATT
CCTAATCGTT TAAATGAAGG AATTATTTAT GTTGATCCAT CAAGATTTGG TTTAATTAAA
CAAGATGATG GTTTTTATAG ATATGATTCA ACTAGTTCTA AATTAGTTGT AAGTTCAAAT
AATGAATGAG AATCATTTTA TTCATTAAAA ACAAAAGATA AATTAAATGA TCAGATCATT
GATTGGATGA ATCAATATTT TAATCAATTA ATTAATAAAA GAACACAAAA TAAATGAATT
TATAAATTAG ATGATTCAAA TTATAGATTT AGTTCAAGAA CTAATGTTAT TAAAAAAACT
ATTAGTGCTT ATAATATTTA TTCTGTTGCT GTTTTATTAG CTGTTATTAG CGTTGTTTTA
TATACTACTT TTTTAATTAC TAAAAAACAA ATTTTAAATT CTCGTGGTCA AATAGGGACA
ATGAGAGCAA TTGGGTATAA AAAACGTCAA ATGGTGTTTA ACTATGTGAT GATGCCATTT
TTTACAAGTA TTGTAGGTGG GATTTTAGGA TATATTTTAT CTTGTTTAAT TTCAATTATT
ATTATTAATA AATTTGCTAA TTACTTTAGT TTAGATTATG GTGTTTTTAG CTTTGATTGA
ATTGGATTTT TAAACAATTT AATTTTTATG TGATTAATTA TTTCAGCAAT TTCATTTTTA
ATTGCTTATT TAATTATGAA AAAAGGAGCA ATTAATTTAT TAGAAAATAG AAATGCTAAA
AAAATTACAA AATTAGGTAA TTTAGTTAAA AGTTTATCTA ATAAAAGAAA GTTTAACCAT
CGTTTAAGAG CTGCTTTATT AGTTGATTCT GGTTCTAAAT TAACTGGAGT TGGATTTGTT
GTTTTAATTG CTACAATTTT ATTTACTATT TCTTTTGTTT CACTAAATTT ATTAAAAAAT
AACAAAATTT ATTCTTATAA TGGAGTTAAG TACAATCAAG TTGTTGAATA TAGTCAACCA
ACTTATAATA ATCCTTTTTC TTTTATAAGA GTATTTAACC CAGATATCAA ATCTAAAAAT
TCTTATAACA TTATTAAAAA TAATGACTCT TATTTAGCTA CTTCTTTACC TAGTAAAAAT
CAAAGTTATG ATTTAGAAAC TATTATTAAA GATTATTTAG ATCAAACTTT TAATAATGCT
TATTATAGTT TAGATATTGA TTTAAAAGAT AAACAAGAAG TTGATTCAAT TAACTTGGCT
TTAGCAAATA TGAAATTATT ACAAGCTCAA GATATTGCTT TAACAAAACA ATATTTTAAA
TATATTGCTA GTTTATCAGC TTCTCCTAGT TCAATAAACT TTATTTTATT AAAAAACTGA
CCTGATTATA TTAATTTAAT TAGTAATCTA AAACAAACAA AATCAAGTGA ATTTGAAACA
TTATTAAATC AGTTTAAATA TTTACAACAA TTTTATGCAA CTTATACTAA TAGTATTGGT
TTAGCTATTA ATAAAGACTA TATTAATAGT TTTGATTTAA AAGATAATGA AAATTTAAAA
ATTAATAAGT TTAATCAAAC TAAAGATGAA CAAATTAATT TAAAAACTAA AGCTTATGAA
GATATTTTAA ATTCTGATCT ATTATCAATA AGTAAATCTA GCTTATCAAA TGATAGTTTT
AAAACTAATA TATTAAAAGA GTTTAAATTA ACAGATAGCA AATCTAGATT AGGGTTGTAT
CATATACTAG ATAATAAGTG AAATAAATCT AATTCTATAT CTGATCAATT TTTAGATATT
TCAGCTTCTG ATTTTATTAA TAAAAAATAT AAATTGGATG ATTTAAAAGA TTTAGTTGCA
AAACTAGTTT TATGATTTAG TGTGATGTTT TATAAAAGAG ATGATCAAGC TTTAATTCAA
GCAGCTTATT CACGTGCTCC TTATTTTGTA AAACAAAACT TAAAGATTTC ATATAATAGT
AATAAAGATT ACACTTTAGG ATTTAATCTA GCTCCTTTTA ATAAAAATTA TGAACAACTA
GGAACTTTAT TAAATGTAAA AACATTAGAT AATAAGCATT TATTTAAAAT TTATGGAATT
CAAAATAATC ATGACTATAT TGATTTATAT GATGAAAATA GAAATGATTT AATTAAAAAA
TTATTTGATT CAGATTCAAA TAGTATTATT ATTAATCAAA CTATAGCAAA AAGATTAAAC
TTAAATACTA ATGATAAGAT TTCATTAAAT GTTTTACAAA ATGAACTACA ACATGTAGAA
AATAATAAAA CTACTGTTTT TAAAACTAGT GATTGATCTA TGAAACAAGA TAATAAATTT
AATAGTTTTG TTCAAAGATC TCAAATTATT ACAGATAATT TAAAAGTTAA AACTAATAAT
GGTTATTTAT CTTTAAACAA TTTTTCAGAT ATTACTAGTT ATTATCAAAG TTATTTAGAT
AATAAACTTA GACTTGTAAA TAAAAGTCAA ACTAAAGAAT TTAAAATAGT TGGTATTCAT
AATGGTTATA ATGAAAGCAT GGCTTGAATT AAAGAAGATG ATGCTCAAAA TATTTTAAAT
TATAAGCAAA ATAAACAAGT TTGATGAAGA GATATTTTTG CTCCTCAATG AAACAAGACT
TTTTCATCAA CTCAAGCAAA ACAAGTTTTA AAAAATACTT TAGATTTAAA TAATAAATCT
TTAACTGATT ATAGTTATGA TCAATTTGTT GAACAATTTA TTAATGATTC TAAAAATCCT
AATCATAATG TAGCTAAAAA AGTTTTACAA ATTTTTAATA ATCAATTTCC AATTTTTAAT
TATAAATATT CAAAAAGTAA CGATATTGGT AATTTAGATA CAATAGTTTC AACTTATTCA
AAAATTGCTG ATTATAATCC TATTAGTTTA AACGGACAAC ATTTAGAAAA TAAAATTGTT
TATGATGGAA TTGGGCAAGG AGTTATTAAA ACTATTACTC CAATTCAAAT TACAAAACAA
ATTTTAGATC AAATCTCTAA TTTAGTAATG TTAGCATTAG TTTTAGCAAT TATTACAATA
TTAATGATTG TATTTGTAAT TATTTTATTA ACTACTTCTT TAATTATTTC AGACAATATT
AGGTTTATTG CTACTTTAAA AGTTTTAGGA TATTCAAATA AATACATTAC AGAAAATATT
TTAGGAATGT ATTTTATAGT TATTGCTAAT ATGTTAGTAA TTGGATTTGT TAGTGGTTGG
TTTATTTTTG ATTCAACTAT TAAATCATTA TATTCAATTA TAGTTCTGCC AATTATTTTT
CCAATTTGAT TACCATTTGC TGTGATTCTT GCAGTTAGTG GAATTTATCT AATTACTTTA
ATTGTTGGAT TTAATTCAAT TTATAAAACT GATGCAACTT TAACTTTAAA AGATAATGAT
GTTTAA
|
|---|
| Protein sequence | MKTKYQKRDK WLGLILKNSL KNSFKYKSQL LGLVLLVMIM SLIMSLISAI NSRVLNKYDN
LITNSNQHNL VLKLDPYENL PTSLITSNNQ IQAQQQYINR LNEKLYSRYN FKFDWSRTES
REFKQVKSLN NLQTLKAISK QYLTNNKVDQ IVIVKGRNIN SNKEVVIDPI YAKKHNIKIN
DIIRFQKDVL GDQLLVNSLN NKQTTQEQFN DINKITKQGL TDVNGIYQIK YASSFDWYQV
VGFANSADFI FPTINAYTPI PNRLNEGIIY VDPSRFGLIK QDDGFYRYDS TSSKLVVSSN
NEWESFYSLK TKDKLNDQII DWMNQYFNQL INKRTQNKWI YKLDDSNYRF SSRTNVIKKT
ISAYNIYSVA VLLAVISVVL YTTFLITKKQ ILNSRGQIGT MRAIGYKKRQ MVFNYVMMPF
FTSIVGGILG YILSCLISII IINKFANYFS LDYGVFSFDW IGFLNNLIFM WLIISAISFL
IAYLIMKKGA INLLENRNAK KITKLGNLVK SLSNKRKFNH RLRAALLVDS GSKLTGVGFV
VLIATILFTI SFVSLNLLKN NKIYSYNGVK YNQVVEYSQP TYNNPFSFIR VFNPDIKSKN
SYNIIKNNDS YLATSLPSKN QSYDLETIIK DYLDQTFNNA YYSLDIDLKD KQEVDSINLA
LANMKLLQAQ DIALTKQYFK YIASLSASPS SINFILLKNW PDYINLISNL KQTKSSEFET
LLNQFKYLQQ FYATYTNSIG LAINKDYINS FDLKDNENLK INKFNQTKDE QINLKTKAYE
DILNSDLLSI SKSSLSNDSF KTNILKEFKL TDSKSRLGLY HILDNKWNKS NSISDQFLDI
SASDFINKKY KLDDLKDLVA KLVLWFSVMF YKRDDQALIQ AAYSRAPYFV KQNLKISYNS
NKDYTLGFNL APFNKNYEQL GTLLNVKTLD NKHLFKIYGI QNNHDYIDLY DENRNDLIKK
LFDSDSNSII INQTIAKRLN LNTNDKISLN VLQNELQHVE NNKTTVFKTS DWSMKQDNKF
NSFVQRSQII TDNLKVKTNN GYLSLNNFSD ITSYYQSYLD NKLRLVNKSQ TKEFKIVGIH
NGYNESMAWI KEDDAQNILN YKQNKQVWWR DIFAPQWNKT FSSTQAKQVL KNTLDLNNKS
LTDYSYDQFV EQFINDSKNP NHNVAKKVLQ IFNNQFPIFN YKYSKSNDIG NLDTIVSTYS
KIADYNPISL NGQHLENKIV YDGIGQGVIK TITPIQITKQ ILDQISNLVM LALVLAIITI
LMIVFVIILL TTSLIISDNI RFIATLKVLG YSNKYITENI LGMYFIVIAN MLVIGFVSGW
FIFDSTIKSL YSIIVLPIIF PIWLPFAVIL AVSGIYLITL IVGFNSIYKT DATLTLKDND
V
|
|---|
| |