| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | MCAP_0270 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 3829028 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_007633 |
|---|
| Strand | - |
|---|
| Start bp | 326350 |
|---|
| End bp | 331656 |
|---|
| Gene Length | 5307 bp |
|---|
| Protein Length | 1768 aa |
|---|
| Translation table | 4 |
|---|
| GC content | 21% |
|---|
| IMG OID | 637823428 |
|---|
| Product | ABC transporter, permease protein, putative |
|---|
| Protein accession | YP_424256 |
|---|
| Protein GI | 83319606 |
|---|
| COG category | [M] Cell wall/membrane/envelope biogenesis |
|---|
| COG ID | [COG4591] ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component |
|---|
| TIGRFAM ID | |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 0 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 0.752032 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | n/a |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | n/a |
|---|
| Fosmid clonability | n/a |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | ATGCTTAAAC AGGGCTTAAA ATGAATCATA AAATTTAAAT TACAATTAAT TATTATTATT
TTTTTAACTT TTATAGCTTC TAGTATTTTA ACAATTTCTT TTACAACTAA CAAACGTTTA
AAAACAGCAT ATGATCAAAT AGTTAATAAT TCTAAAAGTC AAAAATTTGA TTCAACTTAT
CAAATAGTTG TAGGAAATAA AGCAAAACCA GAAAATGGTG ATCCTTTATT TGTTCCTATT
TTTGATTTTA TAAACAAAGA ATATACTGGA TTTAATGATG AAGGTTTTAG TAATTTTAAT
TTATATTTTA ATAAATTTTA TGGAAAAGAA ACTTTATTAA CTAAAGTAAT TGGTTCAGAT
GAATTTAAAA AAAATTGAAC TAGTGATAAA AATAAAAATT TATTTTTAAA AGATCAAAAA
GATGAAGAAG TAGCTAAAAA TCAAGAAGAC TTTGATTTTG TAATTAATGA CTTATTATTT
AGTACAATGA TTGATTTATT AAATAAAAAT GATCAAGCAA TTAATAACAC AGTTATTAGT
AAGTATACTA AAACTAATCC AAATTGGTTT AAACACTTTT TAAAAGATAA CAAACCATTT
ACTTGATTAG AGTTTTTAAA TAATAAAGAA CTAATTGATA AATTAGAAAA AGAACATCCT
GAAGAGTTAA AAATTTATTA TTATTCTTAT TATGCTTTTG AATCTTTTTC TCAATATTTA
TTTAAAACAA TTAGAACTTT TATAAGACAT GATAAATGAA AAGATCAAAA AGATAATATA
TCTAAAATTG TGTATGAATT TTTATTTGGA ATTAAATTTG AAGAAAACTT AAATTATTCA
CTTAGAGAAA AATATATTAC TACAAACCAA AATAAATATA CTACTCATTT TAATAAAACT
GTTTTAAAAA CAGAATTTGA AAAAATGAAT TTTTTAAATA AAAATAAAGA AGATAATTTC
TTTAATGACA TTATTGAAAA AGGTTTTAAA GGAATTTTAA GACCACTAAT TGTTTTTATA
AAAGAAGAAA ATAAAAACAT TAATATTGAA AAAGTAGTTC AATATAGTGA AACAAATGAA
TTAAGAGGGT TTTTATCAGG TTCAAATATT TACACACAAA ATGTTGATAA GTTACCTGAA
ATTTTTAAAA ATAATGATTT AGTTGATTTA TTAACTTTAA ATGCTAATCC TTTTTTAAAT
ATTACTAATA AAGCTTCTGG TTTTTTTATT TCTAGTCAAG ATATTAATAA CTCTACTAGT
AAAGATTTTT TAATAACTAG TGCATTTTTA ACTCATCACA AATTAGCAGC CATTACTAAT
GGATATGATT TATACATAAG ACCTGAAATA ATTTTTAATG ATCCAATTAC TAAAAAAACA
TTTAGAATTG TTAATATTTC AAATCAAAAA CATACAAATT ATTTAGTTTT AAATGGAAAT
AAATCTTTAA ATGCTAGTCA AATTACTATT AGTAGACAAT TTGCTAAAGC TAATAAAATA
AAAATTGGTT CTAGTATTAA TTTAGGTCAA GCAGTTGGAT TAATAGTTTC AGGGTATGCT
GTTGATACTT ATTCATTTTT CCCAACTTCA GATCCAAATG TTCCTTTACC AAAATCTGAT
TCAGGTGGAT TAGTTTATGC TAGTGATAAA ACAATTAATC AAATTATTGG AGATCAAACT
GATCCAAGCA ATAACGATCA AACAACAATT TATAATTTCT TTTTAATTAA AAAAAATAAC
GATGCTAATT TAAAAAATGT TTATTTAGAT CATTTTTCAA AAGCTAATAA GATTAGAGAA
AATATTAAGG CTTATAATAG CCAAAATAAA GCAGATACTT TTTATAAAAC TTTAAGTTTT
GATAAGTCTT GGTATTCATT AAATTGAACT TTGTATCAAA AAATTACTTT TTGATATTCT
TTAGCTACTT TTTTAACTTC TAGTCTAATT GCTCTTATTT CAGCTTTAGC TGTATTTGTA
GGAGTTATTA AATCAATCCA AGCTAATGCA AAACAAATAG GTATTTTAAA AGCAAATGGA
GTTTATAGTA AAACTATAGC TAGTTCTTAT ATTTGATATG CTTTAATTTT AGTTTTTATT
CCTATTCCAA TAGGTTGAAT GTTAGGAACA ATTTTACAAG TACCTTTCGT TGGAATTTTT
AAAGACTATT TTAGTTTAAA AGTTGAAGTA ATTGAATTTG ATTGAATTTC AATCATAATT
AGTGTTATTA TTTTTGGAAT TTTAATTGGA TTATTTTCAT TTATTGTTGC TGTAATTAAT
ATTAATAAAC CAGTATTAGA AGTTATTAAT CACACTAAAA AGTGATCAAA ACCAAAGATT
ACAGATTGAT TATCTAAATA TTTATTTAAA AGGTTAAAGT TTAATACTTT ATTAATGTTA
AAGCTAACTG AATCTGGAAA AAAACCATTT AGTTTGTTAT TAATTTTATT ATTTATAGCA
ACTTTATTTA CTTCAGTAGG AATTGCAATT CCATCAATTG CAATACATAC CAAAGATACT
TATTTTAAAA ATATTAATTA CAATAATGAG TATCAAATTT TTAATAATGT TACTAATACT
CCATTAGGAA AAGATGTTAT TAATCTTTGA AATGGTCATC AAAATTTAGA CAATAGCTAT
AAAACAATTA AAACAACTCA TCAAAATATT AGTTATTATG ATGACCCAAA TAGTTATACT
TTATCAGTAC AAAATTCATC AATATTACCT AATTTGATTT ATAAAATAAA TAACAAAGAT
GCTAATAAAG CTGAAATTTT AACTCCTTAT AAGTCATTTA TTAAAAACTA TTTAGAAAGT
GGTATTTCTG ATTTATATAC TAATTTATTA GATTGAGCAG TTTATCAGTT AAGTATTGCA
AATAGCAGAA GTATTTTAAT TGGTAATATT GAACAATTAT ATGCATATAT TTTAAATGAC
GCAGATCTTA ACAAACATTT TGAAAATGAT AAAGCAAAAC TAGATTTTTT AAACATCACA
ACTCAACCTT TGACTCAATT TGTTTCAAGA ATACTAGAAG TTGTTTTTGA TAGTAAAGTT
CAAAAAGATA CTGATTGAAA AGAAAAAATT TTAAATTTAG TTTTAGGTTA TGCTCCACCT
TTTATTAAAT CTTATTTAAC AAATGATTCT AGAAAGACTC AACTAGCTTT TGGGTTTCAA
TCTCAAAATG TTATTAGTAA AAAAGATCAA CTTGCTACTA GTTTTATTCC ATTTTTAAAT
AATAAAAAAG CTAATTATCA AATTTTAGGA TTAGATAAAA CTCAAAATAG TTTTAAAATA
GAACAAAATT TAAAAGAACA AGTCTTTTTA TCAAATAGTG ATATTCAAAA TATTTATCAA
ATTATTAATT CTCCTTATAC AAATAATGGA ACTGATTTAG TTTCAAATAA AACTAAACAA
ATTCTTTATA ATAGAAAAAC TAATACTTTA ATAGTTCCAA CTATTTTAAA TCAAACCTTA
AGTCAAAATT CAAAATATAA TCAAAATATT TTAGAAAATA TTAGTTCTAA AAATTATCAA
TTAATGTATA AGACTAAATC TAATGATTTT AAAGTTCTAC CAAAACAAGC TTGATTGTAT
GATGATTCTG ATTATTTACA AACTAAATAT GTAACCAAAC ATAACAATTG AATAGATCAA
CCAATTCAAA GTATTAATAC TACAAATAAT TATTCATCTT ATGGTTATGA AGTAGTTGAT
TTTAATAACA CTAAAAGTTA TTATTTAAAT CCTTATAATT TAGATGTTAA TAAATTTACA
CAAAGACAAG TTATAGATCT TTATTCAGAT AAATTAGAAA ATAATAATGA TTTGAGTATA
GAAAAACAAG TTGATAACAT TGTTGAAAAT TCTCCGATAT TTGGTGATTT TGTTATTAAT
AATAGTGGAG AAATTATTAA ATCATTTTTA AGACCATATT ATCAGTTAAG AAATTTAAAA
TTATTTATTC CTATTTCAAA TGAAATTAGT TGAGAAGATT TTGCAAAATA TAGCTTAGGT
TGAGGAAATA ATAAAGAACC AAATGATGAT TGAAAAACTA ATCTAGATAA AAATGATCAA
AAAACTAGAG AATATATTCA ACCAGCTTTA AAAAAACTAA AATCTGAACA AGTTCCACTT
TCAGTTAAAA ATGCTTGAAA CTCTGTTTTA ACTAATAATC AAATAAATGA GTATTTAGAA
ATAAGACCTT ATGATTTTTC AATAGAACAA GAAAGAAGAA TTGATAAACG TCATATTTAT
TTTGCATTTA CAAACAATTA TGAAAAAATT AAAGGTGTTT TAAAATCATC TCCAACTATT
GCATTAGATA ATTTAATTTT AAATGGTAGT GCATTATTTT ATAGAAGAGC ATTAGGTAAA
AGACAAAATG TACCAGCTAT TTTAAAACTA GAAAATAGTA AAGTAAATTA TGTTAATAAA
AATCTTAAAA TTAAATTAAA AAATGTTGGA GTTAGTGATA TATATGGTAA GTCATATGCT
ATTGTTGATT CAGATTTAGC AAATATGATT TATGGTTATG ATATTAGTAG GTCTATAAAT
TATGATTATA AACCATTTGA TACTTCTAAA ATAATTACAA AAAACCAATT ATTTAATACT
TATAAAACAA CAACTTGACA AAAACAAAAT AATTTAGATC CTTGAAATAA TACTTATTTG
AAAACAAAAG ATGTTTTTAA TTATTCACCG CATTACTATT ACAATACAAT TTTTTCAAAT
ACAAGTGAAC CTTTAACAAT TACAAGTTCA GTTTCTATTA TTCCTGAAAA AAGATTAGGG
TTAGCAATTA TTGACTTATT AAATTTAAGT GATTATAAAA CTGCAATTTC TGATATTAAT
TTTATAAATC AAACTAAACA ACTAATTGAT CAATTAACTA AAACTTCAAT TTATATAGCA
ATTATTATCA TTACTGCTAT TGTTTTATCT TCTTCATTAT TGATTATATT AATAACTGGA
ATATATATAA GTCAGTATAA GTCCTTTATG ATAATGTTAA GATCAATGGG TTATAAAAAT
AGTCAAATAA TTTGATATGT ATTAGGTATT ACTAAAATCT TTAATATACT AATTATTCTT
CTAACAATAA GTATTGTCTT TGTATCAATT ATAATTTTTA ATCAGTTGTT TGTTATTAGT
AATATTTCTA TACCTATTGG AACACAATGA TGAGCACCAT TAATTTGTGT AGTTTTAATT
CTTTTTTCAT TTTTTGTTTC AATTTGAATT TCAACTAGAA AAATTAGAAA AACTCAACCA
AACTTTGTTT TAAATGAAAT TGAATAA
|
|---|
| Protein sequence | MLKQGLKWII KFKLQLIIII FLTFIASSIL TISFTTNKRL KTAYDQIVNN SKSQKFDSTY
QIVVGNKAKP ENGDPLFVPI FDFINKEYTG FNDEGFSNFN LYFNKFYGKE TLLTKVIGSD
EFKKNWTSDK NKNLFLKDQK DEEVAKNQED FDFVINDLLF STMIDLLNKN DQAINNTVIS
KYTKTNPNWF KHFLKDNKPF TWLEFLNNKE LIDKLEKEHP EELKIYYYSY YAFESFSQYL
FKTIRTFIRH DKWKDQKDNI SKIVYEFLFG IKFEENLNYS LREKYITTNQ NKYTTHFNKT
VLKTEFEKMN FLNKNKEDNF FNDIIEKGFK GILRPLIVFI KEENKNINIE KVVQYSETNE
LRGFLSGSNI YTQNVDKLPE IFKNNDLVDL LTLNANPFLN ITNKASGFFI SSQDINNSTS
KDFLITSAFL THHKLAAITN GYDLYIRPEI IFNDPITKKT FRIVNISNQK HTNYLVLNGN
KSLNASQITI SRQFAKANKI KIGSSINLGQ AVGLIVSGYA VDTYSFFPTS DPNVPLPKSD
SGGLVYASDK TINQIIGDQT DPSNNDQTTI YNFFLIKKNN DANLKNVYLD HFSKANKIRE
NIKAYNSQNK ADTFYKTLSF DKSWYSLNWT LYQKITFWYS LATFLTSSLI ALISALAVFV
GVIKSIQANA KQIGILKANG VYSKTIASSY IWYALILVFI PIPIGWMLGT ILQVPFVGIF
KDYFSLKVEV IEFDWISIII SVIIFGILIG LFSFIVAVIN INKPVLEVIN HTKKWSKPKI
TDWLSKYLFK RLKFNTLLML KLTESGKKPF SLLLILLFIA TLFTSVGIAI PSIAIHTKDT
YFKNINYNNE YQIFNNVTNT PLGKDVINLW NGHQNLDNSY KTIKTTHQNI SYYDDPNSYT
LSVQNSSILP NLIYKINNKD ANKAEILTPY KSFIKNYLES GISDLYTNLL DWAVYQLSIA
NSRSILIGNI EQLYAYILND ADLNKHFEND KAKLDFLNIT TQPLTQFVSR ILEVVFDSKV
QKDTDWKEKI LNLVLGYAPP FIKSYLTNDS RKTQLAFGFQ SQNVISKKDQ LATSFIPFLN
NKKANYQILG LDKTQNSFKI EQNLKEQVFL SNSDIQNIYQ IINSPYTNNG TDLVSNKTKQ
ILYNRKTNTL IVPTILNQTL SQNSKYNQNI LENISSKNYQ LMYKTKSNDF KVLPKQAWLY
DDSDYLQTKY VTKHNNWIDQ PIQSINTTNN YSSYGYEVVD FNNTKSYYLN PYNLDVNKFT
QRQVIDLYSD KLENNNDLSI EKQVDNIVEN SPIFGDFVIN NSGEIIKSFL RPYYQLRNLK
LFIPISNEIS WEDFAKYSLG WGNNKEPNDD WKTNLDKNDQ KTREYIQPAL KKLKSEQVPL
SVKNAWNSVL TNNQINEYLE IRPYDFSIEQ ERRIDKRHIY FAFTNNYEKI KGVLKSSPTI
ALDNLILNGS ALFYRRALGK RQNVPAILKL ENSKVNYVNK NLKIKLKNVG VSDIYGKSYA
IVDSDLANMI YGYDISRSIN YDYKPFDTSK IITKNQLFNT YKTTTWQKQN NLDPWNNTYL
KTKDVFNYSP HYYYNTIFSN TSEPLTITSS VSIIPEKRLG LAIIDLLNLS DYKTAISDIN
FINQTKQLID QLTKTSIYIA IIIITAIVLS SSLLIILITG IYISQYKSFM IMLRSMGYKN
SQIIWYVLGI TKIFNILIIL LTISIVFVSI IIFNQLFVIS NISIPIGTQW WAPLICVVLI
LFSFFVSIWI STRKIRKTQP NFVLNEIE
|
|---|
| |