16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0270 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0018  hypothetical protein  60.62 
 
 
1797 aa  2105    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0270  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
1768 aa  3501    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.752032  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0511  hypothetical protein  28.39 
 
 
1753 aa  570  1e-161  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.665267  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl261  unknown substrate ABC transporter permease component  27.42 
 
 
1693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000900021  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl262  unknown substrate ABC transporter permease component  27.43 
 
 
1724 aa  487  1e-136  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00148086  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl159  unknown substrate ABC transporter permease component  25.41 
 
 
1814 aa  291  7e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.762494  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl156  unknown substrate ABC transporter permease  23.51 
 
 
1429 aa  73.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0381  hypothetical protein  21.46 
 
 
1481 aa  60.5  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.577318  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0664  hypothetical protein  24.3 
 
 
1381 aa  60.1  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.315875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 
797 aa  50.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  22.52 
 
 
743 aa  49.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  20.98 
 
 
779 aa  47.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0323  efflux ABC transporter, permease protein  30.16 
 
 
1575 aa  47  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.212525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  25.89 
 
 
662 aa  46.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  22.61 
 
 
735 aa  46.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  22.61 
 
 
779 aa  46.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>