| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | UUR10_0323 |
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| Symbol | |
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| ID | 6983753 |
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| Type | CDS |
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| Is gene spliced | No |
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| Is pseudo gene | No |
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| Organism name | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 |
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| Kingdom | Bacteria |
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| Replicon accession | NC_011374 |
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| Strand | + |
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| Start bp | 358494 |
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| End bp | 363221 |
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| Gene Length | 4728 bp |
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| Protein Length | 1575 aa |
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| Translation table | 4 |
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| GC content | 24% |
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| IMG OID | 643399895 |
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| Product | efflux ABC transporter, permease protein |
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| Protein accession | YP_002284716 |
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| Protein GI | 209554602 |
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| COG category | |
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| COG ID | |
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| TIGRFAM ID | |
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Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 1 |
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| Plasmid unclonability p-value | 0.212525 |
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| Plasmid hitchhiking | No |
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| Plasmid clonability | normal |
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Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
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| Fosmid unclonability p-value | n/a |
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| Fosmid Hitchhiker | n/a |
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| Fosmid clonability | n/a |
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Sequence |
| Gene sequence | ATGTTTAAAA ATTTAATTAA GAATGTCTAT CGTTATTTAC TAAAAAGCAA AGCCTCTTTT
ATAGGTCTTT GCCTTTTATT ATTTGTGTCA ATTTTTAGTT TTAGTATGTT AACAAACCTT
TCTAAAACAC TAACACGATC ATACACTAAT TTAGTTAATA AGCAAAAATT ACATGATATT
ACTGTTAATG AAAGTTATAT TGAAGATCAA AAAAGTGTTA AGCAAGCACA ATTTAATAAA
CTTTTAGGTG AATTGAAATT ATTTTATGCA CTACAAGGTT TAAATTTTGA TTGAACTCGT
TCAAATTCAT TAATTGTTAA TTCTACAAAA GATGATATTA CTTATAAAAT TGTTGAATAT
TCAACAAATA AGCAAATTAA CACGTTTGAT GAACAAACAA TTAAACGTTT AGTTGCTAAT
AGTTTTTTTG ATGTTGATTT ATATAGTATT TTAAATAATG CTAAAGCTGA CGTTATTGAT
TTAATTAAAA CTAAAAATTT TAATACTAAC CTTATTGTTA ATAATTTAAA AGAGTTAGAA
GATAATCCAA AAATTAATTT AGTTAAATTA AACAAAGTTG ATAATTATGA TGTTAGCAAT
AGTCAACAAG CACGTCTTTA TTTATTAAAA AATATTGTTT ATGGTGCATG ACCATCAAAA
ACAAATAGTT TATATACAAG TTTTAAAAAA GCTTATGAAT ATAGCTTAGA AGATAAAAAC
TATGATCCTT TAGTTGGTAA TGTAAAACTA AATAATAAAA CTAATTTTGA TGCTTTAGAA
GCCAAAAAAA TTAGTACCCA ATTTATTTTA ATGCTATATC CATCAAAAAA AGGTATAAGT
TTAAATGGTA ATGTTAATAC TGTTGTTAAA GGGCATCGAA TAACCTTTAG TTTTGAACCT
GCTGGTATTC CTATTCCAGT TTATTTTGAT GTTAAATCAG CATATACACT AGTTGGTTTA
GGTGCGTTTT TATCTAGTCA TAACAAACAA AAATATCCAA TGGATTTATG ACAAAAAGCT
TTAGTTGAAC ATCAAGACCA AAAAAGTTTT GAAAAATGAT TTAATAGTTT AGATGAAAAA
TATATTGTTC ATATTGATAA TACACCTTAT CTAATTTTAG ATAGTGGAAT TACACCTGAT
TTCATGTATC CAATTATTTC ATTTACATCT GTTATTCCTA ACCCTAAAAA AGAAGGTTTA
GTATATGCTA ATTTAAATGG ATATGCTCGT ATTCATGATG CTTTTAGATC GAACCCAGCT
GAAAAGAATT TGCAAATTCG GATTACTAAT CAAAAGCATG AAGCTGTTGA TATTAATACT
TTAAAAAAGA TTACTAAAGA TTTAAATGAT CGAATTAAAA AAGAAAGTAT TATGAATTGA
CCAACAAGCT TGGATGCAGC ATATTTAAAA GATGATACTA ACAATCATAT TACACCAAGC
CCACTAAGAT TAGTTTTTAT TGATAAAATT ACAAGTACAA TCCAAACATT TAGTATTCTA
ATAACTTTAT TTATTTTAGT TTTAGCTGTT TTTGTAGTCG TTATTATTAT TAATCGTTTC
TTAGCTCAAA ACAAAATCAA TATTGGAATT TCAATTGCCA ATGGTGTTGC TCGTTGAAAA
ATTATTTTAA GTTTTGGTTT TATTGGATTA ATTCCATGTG TTGTTGGCGG GTTGTGTGGT
TATTTAGTAG CTTATTTTAC GCAAAATTTA GCCGTTAGTA TTTTTAGTGG ATACTGACTA
ATTCCTACAG CTTTAGAAGG TTTTGATTTT GGTGCTTTAA TAACAGTTAT TGTTTTCCCA
TTTTTACTAT TTTTTGCTTT AATAGCTATT TTAGGATATT GATCAGTAAG AAAACCGCCA
ATTAATTTAA TGCGTGGTAC AGAAACATTT AAGATTTCTA AAATTGTTCA TGTTATTAAA
TTGCCATTTA AATACATGAG TGGTTTTAAT AAATATTTAA TTACCCTATC ATTTTCATCG
ATCACAAGAA TTATTATTTT TTCAATAATG ATTGCTTTAT CATTTGGATC AATTATGTTC
TTAACTGGAA CAAGAGGAAA AATTAAACAA ACGACAGATG CAACATTGCA AACAAAAAAA
TATCGTTATG GAATCGATTT AATAACACCA ACAGATCAAG GTGGTCAATA TATCTCTTTA
AGCACAAATC AGATTGGTTC AACATTAAGT GATGAAAACA ACCATGAATT AACCCAAAAA
TACGAAAGTA GTGATTATAA AGATTTTATT AATTCACCAT TATTTAAAAA TTTACAAAAC
TTAAAATTAA TTGGTGCAAA AGATGATCAA CGTCGAACTT ATGACATCAA CTATATTGCC
AATGCTTTCC AAGTTAAACA ATTTTTAGAT TTTAATTTTG GTTTTGGAGA TATTAATAGT
GGTAGTTCAA GTAATCCATG AAGCATTACT AAATCATTAA TTCCTGAAAA TAATTTACAA
ATTTTAAATG AAACTTATAA AAAATGAGGT TCAAAACTAA TTAATGATCA TAGTATTTTT
TCCAAACAAC TTATTAAAAA AGGTGTTAAT GAATTAGCTT ATGACAACTT AAATATTCGT
AATAGTTATG ACCCAAACGA ATATTTTAAT CCTTTTGAAT TTAAAGATAT TATTAATACA
CATTTAAAAC AATTTGATAA ATCACTTTTA GATCAACATG TGTCATATGA AATTTTAGTG
CGTGTACACA ACAACTTATT TAATTATAAA AATATTTATG GCAAATTAGT TTTTAGAAAA
AACGAATGAA TCATTTATTT TGAAAATAGT AATTTTAGTA TTGGTGATCA AAACTTTATT
AGTGGAATTT ATTATAAAAA ATCTAATGAA CAAGATTATG ATTTAGATCA TCATATTTTT
AAAAATGTAG ATTTAATTTA TGATGAAATT TATTTTGAAC GAAATCGAAA ACAAAATTAT
CAAAAATTAA TTTATCAAAC ATTTAGTTCA TATTTTAGAA CACGTTTTTT AAAATATGAT
CCAGAGGGTA ATTTCAATTA TTTATTACCA CTAAAATATC TTAATGCAAC AATTGTTAGA
AAAGAGTTGT TACAAAACGC AATTAATAAC GAAATCATTT TTAAAAATGA ACAAAATAAA
ATAACTAAAA AAATTAGTTT TAAAAATGAT AATGATCTAG TTATTACTAA AATTAATGAT
GCAACTTATG AGATTAAAAA TGTTGTTAAT AATCAAATTT ATATTTATTA TCCAAGACAA
ATTAAGCGTT CTTATAAAAT TGATCCAGCC AAAGCTACTA ATGCAATTAA AACTGGATTA
TCTGTTAAAT TAGATAATGA TTTTATTAAT TTAGTATTAT TAACTCATCC ATCAATTAAT
CCATCTTACA CTGATGTTTG ATCAGGTATT ACATTTAATA TGATTGGTTT TGATTATTTA
ACAAAAAATA ATAAGACACA ATTAAATGAA TTTGATGAAC CATACATTTG AATTGATGCG
CAAATTAATA AAATTAACAA GCAAAAATAT GAAGAAGCTA AAAATCCTAA AATCATTGGA
ATTATTAAAA ATTCAAAATT AGTCCATTTA TTATCTAATA AAAAACAAAT TAATCATTTA
TTGTTTAATG AAAATGATGA ACAAGTAGCA ATTATTAATC GAGTCGCTGC AAAATATTAC
AATTTAAAAA TAGGTGATCA TTTTAGTTTT GTTGCTAATA ATCAAACAAA TCGATATACA
AAAGATTATG TTAAAAAACA AATTACTCTA AAAGTTGTTG GAATAATTGA TACTTACCAA
GAAATTGAAA TTTATACTGG AATTAAAAAT GCGGCACAAA TTTTAGGAAT GCATAGTTCG
CCATACGCTG ATAAATCATT GTATGAAGGA TATGATGGTG CTTTTAATGG AATCTTTACA
AACAAAAGCG ATCCAGCGAT GCTAACACGG ATTATTTCTA TTTATTCACC ATCTGGTTTA
TATCCTGTTT CAGAAATATG AAAAAAAGAC GCAGCAACAA TTGATTTAAT TAAAAATATT
TTAAGTGATA AATATTCAAT GTATGAATTA AATAATAAAT CAGACCCTAA ATCATTAGTT
TTAAGTTCGC GTTTATCTTT AACAAAAGCT TTAGGTTATA AAGATTTTAA TACACTTAAA
TTAGACGCTC GTAATATTTA TGATGAAAAC CATAACTATT TAGGATTAAG AAATGAACAA
GCTCAAGCTG AATGAGTAAT TGATAAATTA ATTAGTATTT ATGGACGTGA TACTTACTCA
TCAACTTTAA AAAATGTTGA AGTAGTAGAT GTTTTATTTG CAGTTTTAGA AACTGCTTCA
AAAACAATTC AAACTGTAGA AATTGTTGTA ATCCTTTTAA TCTTATTTAT CATTATCTTA
GTTCTTGTTT TAATGTCAAT TAATTCATTA TCAGATATAT TAAAAGTTGC TAAATTATTA
AAAAACATGG GTTATAATGA TTTAAAAAAT GCACAATTAT TCTTAATGGC CTTTTTACCC
CCATTAATTA TTGGATCAAT TATTTCAATT CCATTAGTTG TTTTAGTAAT GCAAGCATTT
AGTGAAATGA TTTTCAATAG TTTAAATGTT TTATTAACAA CCGGTTTTAT TTGATGACAT
TTTTTAATTA TCTTATTAAT TGTTGCGATT ATTTTCTTGA TAATGTGAGC AATTGCTATT
CGCATTTTAA GGACATCAAA TATTGCTGAT GCAAGTAAGC GTGGTTAA
|
|---|
| Protein sequence | MFKNLIKNVY RYLLKSKASF IGLCLLLFVS IFSFSMLTNL SKTLTRSYTN LVNKQKLHDI
TVNESYIEDQ KSVKQAQFNK LLGELKLFYA LQGLNFDWTR SNSLIVNSTK DDITYKIVEY
STNKQINTFD EQTIKRLVAN SFFDVDLYSI LNNAKADVID LIKTKNFNTN LIVNNLKELE
DNPKINLVKL NKVDNYDVSN SQQARLYLLK NIVYGAWPSK TNSLYTSFKK AYEYSLEDKN
YDPLVGNVKL NNKTNFDALE AKKISTQFIL MLYPSKKGIS LNGNVNTVVK GHRITFSFEP
AGIPIPVYFD VKSAYTLVGL GAFLSSHNKQ KYPMDLWQKA LVEHQDQKSF EKWFNSLDEK
YIVHIDNTPY LILDSGITPD FMYPIISFTS VIPNPKKEGL VYANLNGYAR IHDAFRSNPA
EKNLQIRITN QKHEAVDINT LKKITKDLND RIKKESIMNW PTSLDAAYLK DDTNNHITPS
PLRLVFIDKI TSTIQTFSIL ITLFILVLAV FVVVIIINRF LAQNKINIGI SIANGVARWK
IILSFGFIGL IPCVVGGLCG YLVAYFTQNL AVSIFSGYWL IPTALEGFDF GALITVIVFP
FLLFFALIAI LGYWSVRKPP INLMRGTETF KISKIVHVIK LPFKYMSGFN KYLITLSFSS
ITRIIIFSIM IALSFGSIMF LTGTRGKIKQ TTDATLQTKK YRYGIDLITP TDQGGQYISL
STNQIGSTLS DENNHELTQK YESSDYKDFI NSPLFKNLQN LKLIGAKDDQ RRTYDINYIA
NAFQVKQFLD FNFGFGDINS GSSSNPWSIT KSLIPENNLQ ILNETYKKWG SKLINDHSIF
SKQLIKKGVN ELAYDNLNIR NSYDPNEYFN PFEFKDIINT HLKQFDKSLL DQHVSYEILV
RVHNNLFNYK NIYGKLVFRK NEWIIYFENS NFSIGDQNFI SGIYYKKSNE QDYDLDHHIF
KNVDLIYDEI YFERNRKQNY QKLIYQTFSS YFRTRFLKYD PEGNFNYLLP LKYLNATIVR
KELLQNAINN EIIFKNEQNK ITKKISFKND NDLVITKIND ATYEIKNVVN NQIYIYYPRQ
IKRSYKIDPA KATNAIKTGL SVKLDNDFIN LVLLTHPSIN PSYTDVWSGI TFNMIGFDYL
TKNNKTQLNE FDEPYIWIDA QINKINKQKY EEAKNPKIIG IIKNSKLVHL LSNKKQINHL
LFNENDEQVA IINRVAAKYY NLKIGDHFSF VANNQTNRYT KDYVKKQITL KVVGIIDTYQ
EIEIYTGIKN AAQILGMHSS PYADKSLYEG YDGAFNGIFT NKSDPAMLTR IISIYSPSGL
YPVSEIWKKD AATIDLIKNI LSDKYSMYEL NNKSDPKSLV LSSRLSLTKA LGYKDFNTLK
LDARNIYDEN HNYLGLRNEQ AQAEWVIDKL ISIYGRDTYS STLKNVEVVD VLFAVLETAS
KTIQTVEIVV ILLILFIIIL VLVLMSINSL SDILKVAKLL KNMGYNDLKN AQLFLMAFLP
PLIIGSIISI PLVVLVMQAF SEMIFNSLNV LLTTGFIWWH FLIILLIVAI IFLIMWAIAI
RILRTSNIAD ASKRG
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