20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0018 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0018  hypothetical protein  100 
 
 
1797 aa  3616    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0270  ABC transporter, permease protein, putative  60.62 
 
 
1768 aa  2053    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.752032  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0511  hypothetical protein  29.52 
 
 
1753 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.665267  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl261  unknown substrate ABC transporter permease component  28.61 
 
 
1693 aa  498  1e-139  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000900021  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl262  unknown substrate ABC transporter permease component  25.52 
 
 
1724 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00148086  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl159  unknown substrate ABC transporter permease component  24.68 
 
 
1814 aa  294  1e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.762494  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl156  unknown substrate ABC transporter permease  22.45 
 
 
1429 aa  72.8  0.00000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0664  hypothetical protein  23.48 
 
 
1381 aa  66.2  0.000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.315875  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0381  hypothetical protein  23.24 
 
 
1481 aa  61.6  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.577318  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  27.78 
 
 
662 aa  59.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl401  unknown substrate ABC transporter permease component  22.25 
 
 
1408 aa  54.7  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  24.38 
 
 
896 aa  53.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  21.18 
 
 
797 aa  51.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  36 
 
 
787 aa  50.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  21.35 
 
 
789 aa  48.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0323  efflux ABC transporter, permease protein  27.13 
 
 
1575 aa  47.4  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.212525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  20.59 
 
 
791 aa  47.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  36.11 
 
 
1090 aa  46.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  20.44 
 
 
779 aa  46.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 
773 aa  46.2  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>