176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0221 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  96.35 
 
 		 384 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  95.57 
 
 		 384 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  96.61 
 
 		 384 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  99.22 
 
 		 384 aa  764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  770    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  96.61 
 
 		 384 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  94.01 
 
 		 384 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  79.95 
 
 		 384 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  80.99 
 
 		 384 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  80.47 
 
 		 384 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  55.58 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  55.58 
 
 		 385 aa  421  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  55.58 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  54.17 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  54.55 
 
 		 385 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  55.32 
 
 		 385 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  54.59 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  52.21 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  50.13 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.51 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  36.39 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  38.24 
 
 		 385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  34.11 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  31.88 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  34.2 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 		 848 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  26.06 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.28 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.77 
 
 		 854 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.54 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  23.98 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.89 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  26.23 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.57 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.55 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.72 
 
 		 422 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.17 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  24.36 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  25 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  21.65 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  21.65 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.31 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  25.48 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  22.73 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 853 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  24.73 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  25.51 
 
 		 857 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.84 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  27.19 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  23.6 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  25.59 
 
 		 828 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  20.19 
 
 		 454 aa  49.7  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  22.36 
 
 		 851 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  24.08 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  34 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  23.15 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1012  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000255652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  29.45 
 
 		 821 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  22.14 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.86 
 
 		 656 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.74 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.43 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 		 930 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.39 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  23.33 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  26.55 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.62 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  20.3 
 
 		 868 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  25.09 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.29 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.13 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.86 
 
 		 805 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.22 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  29.17 
 
 		 647 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  19.91 
 
 		 876 aa  47  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.79 
 
 		 843 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  30.61 
 
 		 869 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.36 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.95 
 
 		 855 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  32.14 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.96 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  34.21 
 
 		 646 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 448 aa  46.6  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  27.92 
 
 		 378 aa  46.2  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.26 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 873 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.95 
 
 		 842 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  33.07 
 
 		 656 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.15 
 
 		 397 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  25.94 
 
 		 793 aa  46.2  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  32.64 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  32.54 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>