More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0252 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 385 aa  783    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  84.42 
 
 		 385 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  45.74 
 
 		 385 aa  277  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  39.27 
 
 		 387 aa  276  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.22 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  37.11 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  37.34 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  37.53 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  40.37 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  35.82 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  36.99 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.86 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  36.86 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  36.86 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  36.6 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  36.6 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  36.86 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  36.6 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  36.76 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  36.15 
 
 		 385 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  36.24 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  35.88 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  38.72 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  36.08 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  37.2 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  30.23 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  23.98 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  24.78 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  31.12 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  26.89 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.76 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  24.33 
 
 		 1132 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.98 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  25.51 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  25.81 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.01 
 
 		 1132 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  25.51 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  25.11 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.99 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.53 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  34.59 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  29.95 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  25.72 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  28.41 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  28.41 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.79 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  28.41 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  28.44 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  22.87 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  31.25 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  39 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  22.87 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  31.86 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  28.09 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  27.21 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.89 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  28.5 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  32.38 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.3 
 
 		 836 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  26.5 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  26.5 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.12 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  25 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  39.81 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  26.5 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  30.7 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.56 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.57 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  36.54 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  26.5 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  22.18 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  26.53 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  32.21 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  29.63 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  31.37 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  24.64 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.3 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  22.46 
 
 		 847 aa  56.6  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  34.48 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.76 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  27.81 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>