More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03341 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  100 
 
 		 385 aa  777    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  84.42 
 
 		 385 aa  627  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  43.53 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.74 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  36.08 
 
 		 388 aa  252  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  39.02 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  35.38 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  35.29 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.31 
 
 		 384 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  35.18 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  38.12 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  34.79 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  34.79 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  35.05 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  35.05 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  35.05 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  34.1 
 
 		 385 aa  205  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  35.88 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  34.79 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  36.25 
 
 		 383 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  35.36 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  35.92 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  35.54 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  32.97 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  27.59 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.73 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25.09 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.09 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  23.85 
 
 		 1132 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.94 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  35.26 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.76 
 
 		 1132 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  28.03 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  29.07 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  27.51 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.1 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.94 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  28.89 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  28.89 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  26.5 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  24.51 
 
 		 794 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  28.89 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.27 
 
 		 836 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25.19 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  27.34 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  30 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  26.41 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  24.13 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  26.29 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  28.21 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  26.07 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  26.07 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  24.12 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  26.07 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  24.54 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.38 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  27.27 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.46 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  23.08 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.06 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  26.05 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  23.29 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  25.4 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  25.09 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  23.7 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  25.09 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.66 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  23.7 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  24.67 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  25.73 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.55 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  33.86 
 
 		 416 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  25.73 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  28.36 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  29.63 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  28.09 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  28.68 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  27.96 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  25.72 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  32.85 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  24.25 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>