190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2522 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  781    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  54.81 
 
 
385 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  53.77 
 
 
385 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  52.21 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  49.61 
 
 
385 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  52.48 
 
 
386 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  50.39 
 
 
385 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  50.39 
 
 
385 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  48.3 
 
 
383 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  50.39 
 
 
384 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  50.13 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  50.13 
 
 
384 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  50.13 
 
 
384 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  50.13 
 
 
384 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  50.13 
 
 
384 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  51.17 
 
 
384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  49.61 
 
 
384 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  48.83 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  49.09 
 
 
384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.88 
 
 
382 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  37.31 
 
 
385 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  37.81 
 
 
385 aa  209  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  33.07 
 
 
388 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  35.38 
 
 
385 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  29.82 
 
 
387 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  31.7 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  31.38 
 
 
379 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  31.14 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.63 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2395  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  23.47 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  28.14 
 
 
400 aa  63.5  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 
413 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  37.29 
 
 
873 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.59 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
857 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  25.2 
 
 
861 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  38.95 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  26.13 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  21.34 
 
 
854 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  23.79 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  31.09 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  37.61 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.11 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.98 
 
 
397 aa  53.5  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  35.9 
 
 
396 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  32.73 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.43 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 
422 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.41 
 
 
848 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
462 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.44 
 
 
871 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  28.37 
 
 
415 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  23.95 
 
 
863 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  16.58 
 
 
850 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  22.01 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  21.15 
 
 
421 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  24.91 
 
 
400 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22 
 
 
419 aa  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.89 
 
 
414 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 
852 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 
873 aa  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  22.89 
 
 
414 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 
395 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2154  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.21 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  25.52 
 
 
417 aa  49.7  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  25.15 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  33.59 
 
 
775 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1734  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.73 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00172788  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1814  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.51 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109352  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  30.34 
 
 
664 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  29.17 
 
 
849 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 
846 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  31.97 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.83 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
941 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2259  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC, putative  22.41 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  23.08 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  29.91 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  28.28 
 
 
421 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.23 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 
400 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  17.2 
 
 
794 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  20.27 
 
 
404 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  25.94 
 
 
418 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  32.8 
 
 
488 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 
806 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 
853 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2285  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.1 
 
 
416 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0114014  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  22.53 
 
 
654 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 
417 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  24.68 
 
 
393 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.69 
 
 
656 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>