139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1793 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  777    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  79.95 
 
 		 384 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  80.47 
 
 		 384 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  84.11 
 
 		 384 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  80.21 
 
 		 384 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  79.69 
 
 		 384 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  79.69 
 
 		 384 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  79.43 
 
 		 384 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  79.69 
 
 		 384 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  83.59 
 
 		 384 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  56.36 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  56.51 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  55.38 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  55.32 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  53.25 
 
 		 385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  53.77 
 
 		 385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  54.55 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  53.77 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  51.17 
 
 		 385 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  36.05 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  34.63 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  36.79 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  31.51 
 
 		 387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  33.96 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  34.12 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  29.77 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  22.91 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 848 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.13 
 
 		 854 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.41 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 		 853 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.39 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.3 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.87 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.17 
 
 		 821 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  26.86 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  31.87 
 
 		 842 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  22.16 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  19.58 
 
 		 858 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  22.08 
 
 		 787 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  27.16 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 		 930 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  23.55 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  23.57 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  35.4 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  24.11 
 
 		 409 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  28.07 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  23.21 
 
 		 873 aa  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.33 
 
 		 857 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  22.32 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  26.43 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  26.86 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  30.33 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.83 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  22.3 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.2 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  23.34 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  25.28 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.39 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.46 
 
 		 876 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  33.08 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.3 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 838 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  25 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.65 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  21.14 
 
 		 792 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  22.29 
 
 		 788 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  21.8 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.98 
 
 		 851 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  24.04 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  21.77 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  23.18 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.88 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  22.43 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  35.96 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.32 
 
 		 843 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.09 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.39 
 
 		 805 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  29.01 
 
 		 861 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2395  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  25.65 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.16 
 
 		 868 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  33.12 
 
 		 668 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  33.12 
 
 		 668 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1012  hypothetical protein  27.27 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000255652 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  27.83 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23.12 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  23.92 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 1177 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  23.45 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  23.92 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  21.73 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>