163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2804 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  96.88 
 
 
384 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  97.4 
 
 
384 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  96.61 
 
 
384 aa  708    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  95.31 
 
 
384 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  99.48 
 
 
384 aa  763    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  79.69 
 
 
384 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  82.03 
 
 
384 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  80.99 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  56.62 
 
 
385 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  56.1 
 
 
385 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  56.88 
 
 
385 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  55.84 
 
 
385 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  55.84 
 
 
385 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  53.65 
 
 
386 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  55.12 
 
 
383 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  53.25 
 
 
385 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  50.13 
 
 
385 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.51 
 
 
382 aa  226  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  37.98 
 
 
385 aa  215  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  36.11 
 
 
385 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  34.37 
 
 
385 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  32.64 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  34.46 
 
 
385 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  32.7 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 
379 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  30.38 
 
 
379 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  22.27 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.74 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 
848 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.04 
 
 
854 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.28 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  25.16 
 
 
425 aa  56.6  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.78 
 
 
420 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.22 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.22 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  24.88 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.71 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1012  hypothetical protein  29.22 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000255652 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  28.07 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  34 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  26.23 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.39 
 
 
857 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 
853 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  24.07 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  25.49 
 
 
828 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.29 
 
 
371 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.56 
 
 
805 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.43 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.15 
 
 
397 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  22.32 
 
 
851 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.86 
 
 
422 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
415 aa  49.7  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  19.53 
 
 
876 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.86 
 
 
422 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.03 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 
930 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  27.92 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.79 
 
 
434 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  19.34 
 
 
858 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.59 
 
 
843 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.53 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.04 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  23.67 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  22.73 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  24.29 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.01 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  22.99 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  20.7 
 
 
868 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.95 
 
 
842 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  21.99 
 
 
459 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  32.14 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 
873 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  28.46 
 
 
798 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  24.38 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.07 
 
 
656 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 
873 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  22.42 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 
430 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  28.04 
 
 
430 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  31.52 
 
 
861 aa  46.6  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  22.73 
 
 
435 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.65 
 
 
416 aa  46.2  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  24.04 
 
 
855 aa  46.2  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  22.41 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.09 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.36 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  21.92 
 
 
1177 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  24.39 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  30.36 
 
 
821 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>