More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1513 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  770    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  42.34 
 
 		 382 aa  322  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  42.52 
 
 		 387 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  40.21 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  45.45 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  43.38 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  38.86 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  41.21 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  37.76 
 
 		 385 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  37.24 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  38.14 
 
 		 385 aa  249  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  38.24 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  38.24 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  38.5 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  38.5 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.95 
 
 		 384 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  37.98 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  35.66 
 
 		 384 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  36.6 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  39.02 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  35.77 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  34.79 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  34.53 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  38.23 
 
 		 384 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  35.33 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  37.06 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  37.85 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  27.09 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  25.74 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.88 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.17 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.25 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.17 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.28 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  33.5 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  21.14 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  25.28 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.97 
 
 		 847 aa  67.4  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  24.16 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  21.69 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.13 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1697  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.06 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.53 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.09 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  20.92 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.41 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  22.8 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  31.69 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  36.29 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.06 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.58 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  37.6 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  21.04 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  25.73 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  26.81 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  33.77 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  21.45 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.74 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  33.06 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  24.36 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  21.28 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.45 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.88 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  35.42 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  36.81 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.37 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  28.4 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.96 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.94 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.26 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  20.33 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 		 848 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  32.24 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  32.24 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  32.24 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  32.24 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  30.2 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  32.24 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  37.07 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  24.1 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  28.19 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14710  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  24.82 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.016176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  28.19 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  30.53 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  28.19 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  37.31 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  29.57 
 
 		 843 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>