85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0730 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0251  hypothetical protein  34.23 
 
 
1589 aa  891    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0730  hypothetical protein  100 
 
 
1720 aa  3489    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0353  protein of unknown function DUF214  42.7 
 
 
1584 aa  1253    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.841166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 
386 aa  66.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  36.72 
 
 
386 aa  64.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 
386 aa  60.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  21.28 
 
 
698 aa  59.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  32.31 
 
 
386 aa  58.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  35.2 
 
 
386 aa  57.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  32.31 
 
 
386 aa  56.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  27.86 
 
 
431 aa  56.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  32.31 
 
 
386 aa  56.2  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  33.04 
 
 
402 aa  54.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 
386 aa  54.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  32.46 
 
 
404 aa  52.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
386 aa  52.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2050  peptide ABC transporter permease  30.08 
 
 
393 aa  52  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  26.35 
 
 
444 aa  51.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  30.95 
 
 
396 aa  51.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  25.17 
 
 
645 aa  50.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  29.59 
 
 
404 aa  50.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  30.43 
 
 
438 aa  50.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  24.59 
 
 
404 aa  49.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  37.4 
 
 
488 aa  49.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  22.44 
 
 
462 aa  49.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
419 aa  49.7  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 
406 aa  49.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.36 
 
 
408 aa  49.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  31.39 
 
 
551 aa  49.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.34 
 
 
402 aa  49.3  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2348  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 
384 aa  49.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.555804  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.73 
 
 
400 aa  49.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  33.33 
 
 
399 aa  48.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  29.73 
 
 
397 aa  48.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  29.91 
 
 
649 aa  48.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  30.77 
 
 
453 aa  48.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 
413 aa  48.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  30.83 
 
 
390 aa  48.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  40.85 
 
 
282 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  30.58 
 
 
371 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  30.16 
 
 
404 aa  47.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 
454 aa  47.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.09 
 
 
642 aa  47.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.3 
 
 
657 aa  47.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  27.12 
 
 
387 aa  47.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.08 
 
 
419 aa  48.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
402 aa  48.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  28.91 
 
 
413 aa  47.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  29.91 
 
 
647 aa  47.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31.58 
 
 
402 aa  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  29.57 
 
 
402 aa  47.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  29.84 
 
 
408 aa  47  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  27.27 
 
 
506 aa  47  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  29.77 
 
 
775 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  27.03 
 
 
394 aa  47  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 
401 aa  47  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  27.82 
 
 
539 aa  47.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  27.43 
 
 
455 aa  47  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  27.41 
 
 
394 aa  47  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  27.83 
 
 
651 aa  47.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
397 aa  46.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 
378 aa  46.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1851  ABC transporter, permease protein, putative  27.47 
 
 
506 aa  47  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00637092  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29.73 
 
 
397 aa  46.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  29.13 
 
 
407 aa  46.6  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
457 aa  46.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.09 
 
 
441 aa  46.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  30.4 
 
 
410 aa  46.6  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.96 
 
 
640 aa  46.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  25.37 
 
 
646 aa  46.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  26.9 
 
 
397 aa  45.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.56 
 
 
842 aa  46.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  33.06 
 
 
400 aa  46.2  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.78 
 
 
552 aa  46.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.25 
 
 
411 aa  46.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.09 
 
 
642 aa  45.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  25.29 
 
 
567 aa  45.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  23.61 
 
 
394 aa  45.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 
431 aa  45.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 
404 aa  45.8  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.75 
 
 
443 aa  45.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 
400 aa  45.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 
405 aa  45.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 
430 aa  45.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  27.2 
 
 
424 aa  45.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>