33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0251 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0730  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1720 aa  865    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0353  protein of unknown function DUF214  37.11 
 
 		 1584 aa  945    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.841166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0251  hypothetical protein  100 
 
 		 1589 aa  3256    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.59 
 
 		 456 aa  64.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  23.79 
 
 		 698 aa  60.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  22.93 
 
 		 491 aa  58.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.63 
 
 		 323 aa  57  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  33.66 
 
 		 528 aa  52  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.47 
 
 		 419 aa  51.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  32.5 
 
 		 386 aa  51.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  28.02 
 
 		 394 aa  50.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  29.6 
 
 		 386 aa  50.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  25 
 
 		 510 aa  50.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  31.37 
 
 		 397 aa  48.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 		 401 aa  48.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  33.61 
 
 		 404 aa  47.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  25.08 
 
 		 539 aa  47.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 436 aa  47.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  36.67 
 
 		 434 aa  47  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  27.78 
 
 		 647 aa  46.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 443 aa  46.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  36.13 
 
 		 452 aa  46.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  26.89 
 
 		 376 aa  46.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 		 395 aa  46.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  28.12 
 
 		 662 aa  45.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  32.59 
 
 		 381 aa  46.2  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 378 aa  45.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  35.44 
 
 		 412 aa  45.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  22.78 
 
 		 416 aa  45.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.34 
 
 		 411 aa  45.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  21.07 
 
 		 414 aa  45.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.03 
 
 		 411 aa  45.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.57 
 
 		 842 aa  45.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>