46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0353 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0730  hypothetical protein  42.7 
 
 
1720 aa  1243    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0353  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
1584 aa  3249    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.841166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0251  hypothetical protein  37.11 
 
 
1589 aa  966    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  34.11 
 
 
386 aa  60.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
436 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  34.11 
 
 
386 aa  56.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.08 
 
 
397 aa  53.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.44 
 
 
411 aa  54.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.47 
 
 
397 aa  52.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23530  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  33.03 
 
 
893 aa  52.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875217 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  29.82 
 
 
413 aa  52  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
386 aa  51.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  30.4 
 
 
396 aa  50.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.85 
 
 
387 aa  50.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 
430 aa  50.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  30.28 
 
 
393 aa  49.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  21.93 
 
 
528 aa  49.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 
431 aa  49.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  44.62 
 
 
488 aa  49.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  23.4 
 
 
412 aa  49.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  33.62 
 
 
861 aa  48.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  29.17 
 
 
645 aa  48.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  33.91 
 
 
662 aa  48.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  31.2 
 
 
390 aa  48.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  30.39 
 
 
404 aa  48.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  26.5 
 
 
367 aa  47.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.83 
 
 
842 aa  47  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  31.15 
 
 
1090 aa  47  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  36.14 
 
 
466 aa  47  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  29.73 
 
 
386 aa  47  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.17 
 
 
647 aa  47.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  30.89 
 
 
1130 aa  46.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  31.48 
 
 
779 aa  46.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  41.38 
 
 
412 aa  46.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  27.33 
 
 
462 aa  46.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 
467 aa  46.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  32.29 
 
 
429 aa  45.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.32 
 
 
370 aa  45.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
419 aa  45.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 
452 aa  45.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  28.68 
 
 
885 aa  45.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  24.44 
 
 
411 aa  45.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  29.73 
 
 
438 aa  45.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  20 
 
 
397 aa  45.1  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 
407 aa  45.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  39.34 
 
 
421 aa  45.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>