29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0615 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  100 
 
 
458 aa  914    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  83.84 
 
 
458 aa  771    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
456 aa  242  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  34.1 
 
 
398 aa  236  8e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  28.73 
 
 
425 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  27.45 
 
 
425 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  28.15 
 
 
478 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  25.36 
 
 
470 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 
474 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  25.36 
 
 
475 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  27.06 
 
 
475 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  22.89 
 
 
439 aa  92  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  24.5 
 
 
505 aa  89.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  22.73 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  21.79 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  25.31 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  23.92 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  23.55 
 
 
451 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  27.46 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  21.11 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 
459 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  24.14 
 
 
484 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1558  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.1 
 
 
468 aa  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.457306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  23.92 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1139  conserved hypothetical integral membrane protein, putative permease  29.6 
 
 
400 aa  45.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  24.55 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  22.36 
 
 
430 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 
484 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  27.17 
 
 
856 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>