39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2078 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  83.84 
 
 		 458 aa  792    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  100 
 
 		 458 aa  909    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  31.78 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  29.27 
 
 		 425 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  28.51 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  24 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  27.97 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  24.36 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  23.85 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  24.36 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  25.88 
 
 		 475 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  22.17 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  23.94 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  26.94 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  24.31 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  22.8 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  27.19 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1558  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.85 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.457306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  21.27 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  25.71 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  23.87 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  24.55 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  28.38 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 484 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  25.78 
 
 		 409 aa  47.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 405 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  23.21 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  25.08 
 
 		 380 aa  46.6  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.06 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  26.13 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  22.8 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  27.93 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  23.26 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  22.74 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>