117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0613 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  100 
 
 		 425 aa  816    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  74.35 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  27.13 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  28.53 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  25.5 
 
 		 439 aa  133  7.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  23.71 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  21.23 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  22.22 
 
 		 409 aa  97.8  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  23.53 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  26.77 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  26.55 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  21.04 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  23.48 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  24.45 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  22.36 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  23.56 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  22.69 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  24.6 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.18 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1558  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.29 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.457306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  26.51 
 
 		 654 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  21.29 
 
 		 707 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  22.98 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  24.31 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.62 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  25.52 
 
 		 654 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  22.38 
 
 		 656 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.1 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  22.43 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.32 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  27.52 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  22.43 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  25.45 
 
 		 654 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  26.16 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.69 
 
 		 640 aa  50.4  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  25 
 
 		 650 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  22.08 
 
 		 399 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  21.4 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.03 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  23.03 
 
 		 656 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  21.05 
 
 		 657 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.48 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  23.11 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  25.41 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  22.73 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  23.5 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  24.6 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  24.86 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.36 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  23.41 
 
 		 663 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  23.67 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.15 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  21.36 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  22.28 
 
 		 484 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  23.53 
 
 		 663 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.25 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  32.38 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  20.99 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  23.76 
 
 		 405 aa  46.6  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  19.93 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  22.65 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  24.56 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  26.84 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  26.54 
 
 		 661 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.28 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  23.81 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.05 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  20.45 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  27.71 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.11 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.63 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  25.11 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  24.56 
 
 		 666 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  26.5 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  26.2 
 
 		 643 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  21.03 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  22.61 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  24.27 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  23.98 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.05 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  28.32 
 
 		 653 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.29 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  19.09 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  29.85 
 
 		 676 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>