84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5456 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  86.32 
 
 
474 aa  811    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  86.19 
 
 
478 aa  790    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  87.61 
 
 
475 aa  810    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  955    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  70.12 
 
 
470 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  27.35 
 
 
491 aa  171  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  28.17 
 
 
485 aa  150  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  27.44 
 
 
451 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  29.41 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  24.13 
 
 
458 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  29.02 
 
 
409 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  25.66 
 
 
458 aa  99  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1623  hypothetical protein  21.7 
 
 
514 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.132347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  24.01 
 
 
464 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  23.06 
 
 
406 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  21.23 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  23.26 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  25.64 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1558  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.36 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.457306  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.22 
 
 
404 aa  63.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.22 
 
 
404 aa  63.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  23.51 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  24.35 
 
 
456 aa  62  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  26.47 
 
 
696 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.73 
 
 
842 aa  53.9  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  29.55 
 
 
641 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.65 
 
 
649 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  28.64 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  29.94 
 
 
641 aa  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.62 
 
 
649 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  25 
 
 
484 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  29.94 
 
 
641 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  22.46 
 
 
429 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.68 
 
 
413 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  22.83 
 
 
642 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 
484 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  30.57 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  21.54 
 
 
840 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  26.15 
 
 
646 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  21.82 
 
 
413 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.85 
 
 
420 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  22.84 
 
 
405 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  22.09 
 
 
653 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  22.09 
 
 
653 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  22.09 
 
 
653 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  22.05 
 
 
420 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 
429 aa  47  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.42 
 
 
642 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  22.87 
 
 
649 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  24.42 
 
 
652 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  22.88 
 
 
650 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  21.43 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  21.43 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  21.43 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  21.43 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  24.47 
 
 
650 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  21.43 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  23.75 
 
 
681 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  20.5 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  21.43 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  21.43 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  21.43 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  23.75 
 
 
681 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  30.48 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  22.67 
 
 
678 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.67 
 
 
678 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  27.7 
 
 
643 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  22.67 
 
 
678 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 
420 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  23.76 
 
 
665 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  22.83 
 
 
819 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  23.24 
 
 
653 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  22.62 
 
 
412 aa  44.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  23.12 
 
 
687 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  24.81 
 
 
420 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  20.09 
 
 
438 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3213  protein of unknown function DUF214  22.48 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.138688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  20.99 
 
 
644 aa  43.9  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  23.75 
 
 
373 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  21.5 
 
 
402 aa  43.5  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 
402 aa  43.5  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>