28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1013 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  100 
 
 
406 aa  811    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
439 aa  276  5e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  23.71 
 
 
425 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  25.21 
 
 
425 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  24.19 
 
 
409 aa  93.6  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  24.81 
 
 
458 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  28.57 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  21.79 
 
 
458 aa  87.4  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  27.65 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  24.02 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  23.93 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  22.81 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  22.73 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  26.67 
 
 
505 aa  79.7  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  21.94 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  22.34 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  21.7 
 
 
451 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 
484 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.08 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.9 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  26.79 
 
 
789 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.76 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  24.62 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 
379 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  24.71 
 
 
430 aa  43.5  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1623  hypothetical protein  23.05 
 
 
514 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.132347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>