25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1623 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1623  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1033    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.132347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  36.86 
 
 
451 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  21.89 
 
 
475 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  21.85 
 
 
475 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  21.42 
 
 
474 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  29.37 
 
 
505 aa  93.2  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  24.18 
 
 
478 aa  90.5  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  22.1 
 
 
470 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  29.3 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  23.62 
 
 
485 aa  67  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1558  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.8 
 
 
468 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.457306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  23.13 
 
 
464 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  28.16 
 
 
425 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  31.17 
 
 
903 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3804  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
378 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  23.05 
 
 
406 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.23 
 
 
1207 aa  45.8  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 
1016 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 
1068 aa  44.7  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  32.84 
 
 
702 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  27.27 
 
 
1090 aa  44.3  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  35.82 
 
 
454 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  44 
 
 
859 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  38.6 
 
 
401 aa  43.5  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  34.43 
 
 
425 aa  43.5  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>