80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2419 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  90.38 
 
 
474 aa  851    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  91.63 
 
 
475 aa  862    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  70.31 
 
 
470 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  86.19 
 
 
475 aa  809    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  959    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  26.79 
 
 
491 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  28.57 
 
 
485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  25.72 
 
 
505 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  26.45 
 
 
451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  25.93 
 
 
458 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  27.99 
 
 
458 aa  103  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  29.72 
 
 
409 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  24.84 
 
 
464 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  23.43 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1623  hypothetical protein  20.48 
 
 
514 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.132347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  24.58 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  25.43 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1558  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.19 
 
 
468 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.457306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  22.7 
 
 
456 aa  61.2  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  21.81 
 
 
425 aa  58.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  28.32 
 
 
641 aa  53.5  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  24.44 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  29.03 
 
 
641 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  24.44 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  29.03 
 
 
641 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  24.85 
 
 
696 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  24.87 
 
 
649 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.46 
 
 
642 aa  50.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  23.61 
 
 
385 aa  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.14 
 
 
381 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  25.79 
 
 
650 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  21.24 
 
 
420 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  22.88 
 
 
429 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.18 
 
 
642 aa  48.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 
484 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  25.42 
 
 
484 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  25.12 
 
 
403 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  20.31 
 
 
420 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 
643 aa  47  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  20.31 
 
 
420 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  21.03 
 
 
653 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  21.03 
 
 
653 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.12 
 
 
649 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.7 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  21.03 
 
 
653 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  21.59 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  20.67 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  20 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  23.49 
 
 
650 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  20 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  20.67 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  20.67 
 
 
648 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  20 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  22.94 
 
 
687 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.12 
 
 
649 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  20 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  20 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25 
 
 
640 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1761  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 
424 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  21.5 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  22.94 
 
 
681 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 
429 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  22.94 
 
 
681 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  26.32 
 
 
646 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.79 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 
777 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  24 
 
 
644 aa  43.9  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  19.95 
 
 
413 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  21.31 
 
 
653 aa  43.9  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2198  ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
421 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000781138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  22.98 
 
 
402 aa  43.5  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3065  ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
420 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3053  ABC transporter permease  34.78 
 
 
420 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3082  ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2772  ABC transporter, permease  34.78 
 
 
420 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00717003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2812  ABC transporter, permease  34.78 
 
 
420 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.02347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2838  ABC transporter permease  34.78 
 
 
420 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0117028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>