32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1142 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 439 aa  861    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  39.3 
 
 		 406 aa  282  8.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  25.5 
 
 		 425 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  26.95 
 
 		 425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  24.94 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  22.89 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  23.53 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  23.22 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  23.24 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  23.27 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  24.53 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  24.9 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  24.12 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  25.14 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  25.22 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  27.5 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  24.53 
 
 		 451 aa  67  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  31.6 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  31.89 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  24.27 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.86 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  25 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.58 
 
 		 640 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  26.46 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  24.78 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  26.74 
 
 		 656 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  25.16 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  29.21 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  29.21 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  20.3 
 
 		 391 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 852 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>