More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 919 aa  1872    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  30.4 
 
 		 885 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  32.59 
 
 		 888 aa  425  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23530  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  31.37 
 
 		 893 aa  372  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875217 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  29.6 
 
 		 903 aa  333  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  32.75 
 
 		 1090 aa  324  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  30.95 
 
 		 1130 aa  305  3.0000000000000004e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  31.95 
 
 		 950 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  30.46 
 
 		 779 aa  241  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  27.69 
 
 		 779 aa  226  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  37.91 
 
 		 664 aa  201  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  39.12 
 
 		 643 aa  199  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  38.21 
 
 		 662 aa  198  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.25 
 
 		 1207 aa  194  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.38 
 
 		 664 aa  191  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  38.11 
 
 		 660 aa  187  8e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  37.01 
 
 		 654 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0192  ABC transporter related  32.62 
 
 		 597 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000020543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  42.48 
 
 		 232 aa  167  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.04 
 
 		 239 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 239 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 230 aa  165  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  41.23 
 
 		 230 aa  164  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.42 
 
 		 245 aa  164  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.1 
 
 		 234 aa  163  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  44.24 
 
 		 233 aa  163  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  41.26 
 
 		 232 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 220 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 244 aa  162  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 226 aa  161  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  40.71 
 
 		 238 aa  161  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  39.46 
 
 		 221 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  42.6 
 
 		 228 aa  160  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 229 aa  160  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  44.5 
 
 		 224 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 234 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.4 
 
 		 653 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  34.75 
 
 		 657 aa  159  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  34.7 
 
 		 656 aa  159  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40.61 
 
 		 225 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  42.86 
 
 		 252 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.4 
 
 		 653 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  35.4 
 
 		 653 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  37.79 
 
 		 651 aa  159  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  43.05 
 
 		 229 aa  159  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  34.53 
 
 		 657 aa  158  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  42.74 
 
 		 288 aa  158  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  40.17 
 
 		 225 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  39.29 
 
 		 234 aa  157  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  35.28 
 
 		 657 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  37.01 
 
 		 668 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  44.93 
 
 		 234 aa  157  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  39.29 
 
 		 234 aa  157  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 219 aa  157  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  33.88 
 
 		 653 aa  156  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 238 aa  157  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 228 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  42.54 
 
 		 246 aa  157  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.44 
 
 		 264 aa  156  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 233 aa  157  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 224 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 224 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 		 224 aa  156  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  41.36 
 
 		 233 aa  156  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  34.38 
 
 		 648 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 254 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 224 aa  156  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  34.38 
 
 		 648 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  40.36 
 
 		 228 aa  156  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 224 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 230 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 244 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  38.33 
 
 		 234 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 252 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 248 aa  154  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  41.26 
 
 		 222 aa  154  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  39.74 
 
 		 225 aa  154  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 266 aa  154  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  40.42 
 
 		 655 aa  154  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 236 aa  154  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  38.84 
 
 		 234 aa  154  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 224 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 244 aa  154  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 		 224 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 		 224 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  38.57 
 
 		 228 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  40.36 
 
 		 221 aa  154  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  37.46 
 
 		 647 aa  153  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.21 
 
 		 233 aa  153  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 233 aa  153  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  40.27 
 
 		 259 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 233 aa  154  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 233 aa  154  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.86 
 
 		 642 aa  154  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  39.22 
 
 		 231 aa  153  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  34.81 
 
 		 650 aa  153  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  42.73 
 
 		 253 aa  154  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  39.57 
 
 		 224 aa  154  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  40.27 
 
 		 238 aa  154  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  38.8 
 
 		 266 aa  154  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>