63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0276 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  46.99 
 
 
973 aa  820    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  43.31 
 
 
968 aa  680    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  39.2 
 
 
953 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  42.67 
 
 
968 aa  659    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
963 aa  1926    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  47.24 
 
 
972 aa  827    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  36.19 
 
 
947 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3150  hypothetical protein  35.71 
 
 
948 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  27.56 
 
 
416 aa  59.7  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1605  hypothetical protein  30.57 
 
 
897 aa  59.7  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.453763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2806  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 
1081 aa  55.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1166  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
1169 aa  55.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 
422 aa  52.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 
413 aa  52.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 
1129 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.53 
 
 
416 aa  50.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  25.32 
 
 
794 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6567  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 
1101 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.44 
 
 
843 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 
853 aa  48.9  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  30.71 
 
 
435 aa  48.9  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  33.96 
 
 
421 aa  48.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0078  hypothetical protein  27.89 
 
 
410 aa  48.1  0.0009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0489  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.57 
 
 
420 aa  47.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0222  hypothetical protein  26.06 
 
 
852 aa  47.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  25.32 
 
 
850 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  30.84 
 
 
842 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  27.06 
 
 
451 aa  47.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1545  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.62 
 
 
407 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0135691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0224  hypothetical protein  26.06 
 
 
852 aa  47.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2360  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.56 
 
 
411 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.069448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.28 
 
 
414 aa  47.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.21 
 
 
420 aa  47  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  32.61 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0127  LolC/E family lipoprotein releasing system transmembrane protein  27.27 
 
 
410 aa  47  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1333  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
1074 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.35 
 
 
434 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  27.78 
 
 
389 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.6 
 
 
426 aa  45.8  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.8 
 
 
422 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  30.11 
 
 
421 aa  45.8  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.41 
 
 
434 aa  45.8  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  23.14 
 
 
847 aa  45.8  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.41 
 
 
415 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 
856 aa  45.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  32.73 
 
 
423 aa  45.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.51 
 
 
841 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1634  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.7 
 
 
417 aa  45.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0870078  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2154  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.37 
 
 
416 aa  45.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
635 aa  45.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 
848 aa  45.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  21.67 
 
 
873 aa  45.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  35.63 
 
 
404 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.04 
 
 
387 aa  45.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  21.15 
 
 
854 aa  45.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.08 
 
 
416 aa  44.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.16 
 
 
439 aa  44.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.19 
 
 
414 aa  44.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 
422 aa  44.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000928533  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.79 
 
 
417 aa  44.3  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.2 
 
 
422 aa  44.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.08 
 
 
416 aa  44.3  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  23.53 
 
 
430 aa  44.3  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>