27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3150 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3150  hypothetical protein  100 
 
 		 948 aa  1843    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  82.07 
 
 		 947 aa  1484    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  38.91 
 
 		 972 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  39.26 
 
 		 973 aa  572  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 		 963 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  34.31 
 
 		 953 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  35.86 
 
 		 968 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  35.8 
 
 		 968 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 930 aa  57.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.08 
 
 		 880 aa  55.1  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.37 
 
 		 845 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  25.72 
 
 		 402 aa  51.2  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 1129 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  19.16 
 
 		 414 aa  49.3  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  19.16 
 
 		 414 aa  49.3  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1166  protein of unknown function DUF214  43.37 
 
 		 1169 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  26.79 
 
 		 403 aa  48.5  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  25.55 
 
 		 441 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  23.48 
 
 		 825 aa  47.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.22 
 
 		 415 aa  47.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 		 866 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 		 848 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  25.45 
 
 		 488 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.81 
 
 		 854 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  21.89 
 
 		 422 aa  45.4  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.81 
 
 		 427 aa  44.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  28.37 
 
 		 422 aa  44.3  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.526116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>