21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4169 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4169  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
1129 aa  2130    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6567  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 
1101 aa  243  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2806  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 
1081 aa  87.8  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1166  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 
1169 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1333  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 
1074 aa  58.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0958  protein of unknown function DUF214  30.67 
 
 
1119 aa  58.2  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.502077  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4045  hypothetical protein  26.3 
 
 
968 aa  57  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.107257  normal  0.0242491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 
963 aa  54.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1203  hypothetical protein  25.29 
 
 
968 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.43548  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  27.72 
 
 
947 aa  52  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  33.54 
 
 
821 aa  51.6  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  37.11 
 
 
855 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  27.31 
 
 
809 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0178  hypothetical protein  26.36 
 
 
972 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.329993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 
853 aa  48.5  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4356  hypothetical protein  25 
 
 
973 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0703153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
775 aa  47.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3150  hypothetical protein  28.64 
 
 
948 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 
953 aa  46.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  34.88 
 
 
861 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  26.41 
 
 
380 aa  45.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>